Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpe65Q91ZQ5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpe65Q91ZQ5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpe65Q91ZQ5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpe65Q91ZQ5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpe65Q91ZQ5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpe65Q91ZQ5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpe65Q91ZQ5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpe65Q91ZQ5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpe65Q91ZQ5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpe65Q91ZQ5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpe65Q91ZQ5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpe65Q91ZQ5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpe65Q91ZQ5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpe65Q91ZQ5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpe65Q91ZQ5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpe65Q91ZQ5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpe65Q91ZQ5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpe65Q91ZQ5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpe65Q91ZQ5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpe65Q91ZQ5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpe65Q91ZQ5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpe65Q91ZQ5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpe65Q91ZQ5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpe65Q91ZQ5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpe65Q91ZQ5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpe65Q91ZQ5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpe65Q91ZQ5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpe65Q91ZQ5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpe65Q91ZQ5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpe65Q91ZQ5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpe65Q91ZQ5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpe65Q91ZQ5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpe65Q91ZQ5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpe65Q91ZQ5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpe65Q91ZQ5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpe65Q91ZQ5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpe65Q91ZQ5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpe65Q91ZQ5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpe65Q91ZQ5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpe65Q91ZQ5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpe65Q91ZQ5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpe65Q91ZQ5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpe65Q91ZQ5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpe65Q91ZQ5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpe65Q91ZQ5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rpe65Q91ZQ5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rpe65Q91ZQ5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rpe65Q91ZQ5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rpe65Q91ZQ5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rpe65Q91ZQ5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rpe65Q91ZQ5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpe65Q91ZQ5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpe65Q91ZQ5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpe65Q91ZQ5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpe65Q91ZQ5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpe65Q91ZQ5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpe65Q91ZQ5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpe65Q91ZQ5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpe65Q91ZQ5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpe65Q91ZQ5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpe65Q91ZQ5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpe65Q91ZQ5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpe65Q91ZQ5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpe65Q91ZQ5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpe65Q91ZQ5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpe65Q91ZQ5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpe65Q91ZQ5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpe65Q91ZQ5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpe65Q91ZQ5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpe65Q91ZQ5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpe65Q91ZQ5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpe65Q91ZQ5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpe65Q91ZQ5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpe65Q91ZQ5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpe65Q91ZQ5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpe65Q91ZQ5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpe65Q91ZQ5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpe65Q91ZQ5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpe65Q91ZQ5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpe65Q91ZQ5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpe65Q91ZQ5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpe65Q91ZQ5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpe65Q91ZQ5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpe65Q91ZQ5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpe65Q91ZQ5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpe65Q91ZQ5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpe65Q91ZQ5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpe65Q91ZQ5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpe65Q91ZQ5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpe65Q91ZQ5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpe65Q91ZQ5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpe65Q91ZQ5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpe65Q91ZQ5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpe65Q91ZQ5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpe65Q91ZQ5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpe65Q91ZQ5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpe65Q91ZQ5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpe65Q91ZQ5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpe65Q91ZQ5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms