Protein–RNA interactions for Protein: Q91WM3

Rrp9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp9Q91WM3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rrp9Q91WM3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rrp9Q91WM3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rrp9Q91WM3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rrp9Q91WM3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rrp9Q91WM3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rrp9Q91WM3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rrp9Q91WM3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rrp9Q91WM3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rrp9Q91WM3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rrp9Q91WM3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rrp9Q91WM3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rrp9Q91WM3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rrp9Q91WM3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rrp9Q91WM3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rrp9Q91WM3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rrp9Q91WM3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rrp9Q91WM3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rrp9Q91WM3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rrp9Q91WM3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rrp9Q91WM3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rrp9Q91WM3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rrp9Q91WM3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rrp9Q91WM3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rrp9Q91WM3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrp9Q91WM3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrp9Q91WM3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrp9Q91WM3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrp9Q91WM3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrp9Q91WM3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrp9Q91WM3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrp9Q91WM3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrp9Q91WM3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrp9Q91WM3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrp9Q91WM3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrp9Q91WM3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rrp9Q91WM3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rrp9Q91WM3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rrp9Q91WM3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rrp9Q91WM3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rrp9Q91WM3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rrp9Q91WM3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rrp9Q91WM3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rrp9Q91WM3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rrp9Q91WM3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rrp9Q91WM3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rrp9Q91WM3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rrp9Q91WM3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rrp9Q91WM3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rrp9Q91WM3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rrp9Q91WM3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rrp9Q91WM3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rrp9Q91WM3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rrp9Q91WM3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rrp9Q91WM3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rrp9Q91WM3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rrp9Q91WM3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rrp9Q91WM3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rrp9Q91WM3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rrp9Q91WM3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rrp9Q91WM3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rrp9Q91WM3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rrp9Q91WM3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rrp9Q91WM3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rrp9Q91WM3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rrp9Q91WM3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rrp9Q91WM3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rrp9Q91WM3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rrp9Q91WM3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rrp9Q91WM3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rrp9Q91WM3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rrp9Q91WM3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rrp9Q91WM3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rrp9Q91WM3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rrp9Q91WM3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rrp9Q91WM3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rrp9Q91WM3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rrp9Q91WM3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrp9Q91WM3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrp9Q91WM3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrp9Q91WM3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrp9Q91WM3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rrp9Q91WM3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rrp9Q91WM3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rrp9Q91WM3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rrp9Q91WM3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rrp9Q91WM3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rrp9Q91WM3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rrp9Q91WM3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrp9Q91WM3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrp9Q91WM3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrp9Q91WM3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrp9Q91WM3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrp9Q91WM3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrp9Q91WM3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrp9Q91WM3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrp9Q91WM3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrp9Q91WM3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrp9Q91WM3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrp9Q91WM3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms