Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIJ6

Sfpq, Splicing factor, proline- and glutamine-rich, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfpqQ8VIJ6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SfpqQ8VIJ6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SfpqQ8VIJ6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SfpqQ8VIJ6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SfpqQ8VIJ6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SfpqQ8VIJ6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SfpqQ8VIJ6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SfpqQ8VIJ6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SfpqQ8VIJ6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SfpqQ8VIJ6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SfpqQ8VIJ6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SfpqQ8VIJ6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SfpqQ8VIJ6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SfpqQ8VIJ6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SfpqQ8VIJ6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SfpqQ8VIJ6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SfpqQ8VIJ6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SfpqQ8VIJ6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SfpqQ8VIJ6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SfpqQ8VIJ6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SfpqQ8VIJ6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SfpqQ8VIJ6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SfpqQ8VIJ6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SfpqQ8VIJ6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SfpqQ8VIJ6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SfpqQ8VIJ6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SfpqQ8VIJ6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SfpqQ8VIJ6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SfpqQ8VIJ6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SfpqQ8VIJ6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SfpqQ8VIJ6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SfpqQ8VIJ6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SfpqQ8VIJ6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SfpqQ8VIJ6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SfpqQ8VIJ6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SfpqQ8VIJ6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SfpqQ8VIJ6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SfpqQ8VIJ6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SfpqQ8VIJ6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SfpqQ8VIJ6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SfpqQ8VIJ6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SfpqQ8VIJ6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SfpqQ8VIJ6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SfpqQ8VIJ6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SfpqQ8VIJ6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SfpqQ8VIJ6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SfpqQ8VIJ6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SfpqQ8VIJ6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SfpqQ8VIJ6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SfpqQ8VIJ6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SfpqQ8VIJ6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SfpqQ8VIJ6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SfpqQ8VIJ6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SfpqQ8VIJ6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SfpqQ8VIJ6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SfpqQ8VIJ6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SfpqQ8VIJ6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SfpqQ8VIJ6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SfpqQ8VIJ6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SfpqQ8VIJ6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SfpqQ8VIJ6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SfpqQ8VIJ6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SfpqQ8VIJ6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SfpqQ8VIJ6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SfpqQ8VIJ6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SfpqQ8VIJ6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SfpqQ8VIJ6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SfpqQ8VIJ6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SfpqQ8VIJ6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SfpqQ8VIJ6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SfpqQ8VIJ6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SfpqQ8VIJ6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SfpqQ8VIJ6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SfpqQ8VIJ6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SfpqQ8VIJ6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SfpqQ8VIJ6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SfpqQ8VIJ6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SfpqQ8VIJ6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SfpqQ8VIJ6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SfpqQ8VIJ6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SfpqQ8VIJ6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SfpqQ8VIJ6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SfpqQ8VIJ6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SfpqQ8VIJ6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SfpqQ8VIJ6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SfpqQ8VIJ6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SfpqQ8VIJ6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SfpqQ8VIJ6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SfpqQ8VIJ6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SfpqQ8VIJ6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SfpqQ8VIJ6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SfpqQ8VIJ6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SfpqQ8VIJ6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SfpqQ8VIJ6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SfpqQ8VIJ6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SfpqQ8VIJ6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SfpqQ8VIJ6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SfpqQ8VIJ6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SfpqQ8VIJ6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SfpqQ8VIJ6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms