Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHI7

Ccdc65, Coiled-coil domain-containing protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc65Q8VHI7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc65Q8VHI7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc65Q8VHI7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc65Q8VHI7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc65Q8VHI7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc65Q8VHI7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc65Q8VHI7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc65Q8VHI7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc65Q8VHI7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc65Q8VHI7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc65Q8VHI7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc65Q8VHI7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc65Q8VHI7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc65Q8VHI7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc65Q8VHI7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc65Q8VHI7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc65Q8VHI7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc65Q8VHI7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc65Q8VHI7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc65Q8VHI7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc65Q8VHI7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc65Q8VHI7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc65Q8VHI7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc65Q8VHI7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc65Q8VHI7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc65Q8VHI7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc65Q8VHI7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc65Q8VHI7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc65Q8VHI7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc65Q8VHI7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc65Q8VHI7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc65Q8VHI7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc65Q8VHI7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc65Q8VHI7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc65Q8VHI7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc65Q8VHI7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc65Q8VHI7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc65Q8VHI7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc65Q8VHI7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc65Q8VHI7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc65Q8VHI7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc65Q8VHI7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc65Q8VHI7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc65Q8VHI7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc65Q8VHI7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc65Q8VHI7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc65Q8VHI7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc65Q8VHI7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc65Q8VHI7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc65Q8VHI7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc65Q8VHI7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc65Q8VHI7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc65Q8VHI7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc65Q8VHI7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc65Q8VHI7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc65Q8VHI7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc65Q8VHI7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc65Q8VHI7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc65Q8VHI7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc65Q8VHI7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc65Q8VHI7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc65Q8VHI7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc65Q8VHI7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc65Q8VHI7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc65Q8VHI7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc65Q8VHI7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc65Q8VHI7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc65Q8VHI7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc65Q8VHI7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc65Q8VHI7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc65Q8VHI7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc65Q8VHI7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc65Q8VHI7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc65Q8VHI7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc65Q8VHI7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc65Q8VHI7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc65Q8VHI7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc65Q8VHI7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc65Q8VHI7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc65Q8VHI7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc65Q8VHI7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc65Q8VHI7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc65Q8VHI7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc65Q8VHI7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc65Q8VHI7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc65Q8VHI7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc65Q8VHI7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc65Q8VHI7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc65Q8VHI7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc65Q8VHI7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc65Q8VHI7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc65Q8VHI7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc65Q8VHI7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc65Q8VHI7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc65Q8VHI7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc65Q8VHI7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc65Q8VHI7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc65Q8VHI7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc65Q8VHI7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc65Q8VHI7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms