Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SelenomQ8VHC3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SelenomQ8VHC3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SelenomQ8VHC3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SelenomQ8VHC3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SelenomQ8VHC3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SelenomQ8VHC3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SelenomQ8VHC3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SelenomQ8VHC3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SelenomQ8VHC3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SelenomQ8VHC3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SelenomQ8VHC3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SelenomQ8VHC3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SelenomQ8VHC3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SelenomQ8VHC3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SelenomQ8VHC3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SelenomQ8VHC3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SelenomQ8VHC3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SelenomQ8VHC3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SelenomQ8VHC3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SelenomQ8VHC3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SelenomQ8VHC3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SelenomQ8VHC3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SelenomQ8VHC3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SelenomQ8VHC3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SelenomQ8VHC3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SelenomQ8VHC3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SelenomQ8VHC3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SelenomQ8VHC3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SelenomQ8VHC3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SelenomQ8VHC3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SelenomQ8VHC3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SelenomQ8VHC3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SelenomQ8VHC3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SelenomQ8VHC3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SelenomQ8VHC3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SelenomQ8VHC3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SelenomQ8VHC3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SelenomQ8VHC3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SelenomQ8VHC3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SelenomQ8VHC3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SelenomQ8VHC3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SelenomQ8VHC3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SelenomQ8VHC3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SelenomQ8VHC3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms