Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc12Q8R344 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc12Q8R344 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc12Q8R344 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc12Q8R344 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc12Q8R344 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc12Q8R344 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc12Q8R344 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc12Q8R344 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc12Q8R344 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc12Q8R344 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc12Q8R344 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc12Q8R344 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc12Q8R344 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc12Q8R344 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc12Q8R344 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc12Q8R344 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc12Q8R344 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc12Q8R344 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc12Q8R344 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc12Q8R344 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc12Q8R344 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc12Q8R344 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc12Q8R344 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc12Q8R344 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc12Q8R344 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc12Q8R344 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc12Q8R344 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc12Q8R344 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc12Q8R344 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc12Q8R344 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc12Q8R344 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc12Q8R344 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc12Q8R344 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc12Q8R344 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc12Q8R344 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc12Q8R344 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc12Q8R344 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc12Q8R344 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc12Q8R344 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc12Q8R344 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc12Q8R344 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc12Q8R344 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc12Q8R344 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc12Q8R344 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc12Q8R344 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc12Q8R344 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc12Q8R344 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc12Q8R344 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc12Q8R344 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc12Q8R344 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc12Q8R344 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc12Q8R344 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc12Q8R344 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc12Q8R344 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc12Q8R344 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc12Q8R344 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc12Q8R344 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc12Q8R344 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc12Q8R344 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc12Q8R344 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc12Q8R344 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc12Q8R344 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc12Q8R344 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc12Q8R344 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc12Q8R344 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc12Q8R344 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc12Q8R344 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc12Q8R344 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc12Q8R344 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc12Q8R344 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc12Q8R344 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc12Q8R344 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc12Q8R344 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc12Q8R344 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc12Q8R344 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc12Q8R344 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc12Q8R344 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc12Q8R344 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc12Q8R344 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc12Q8R344 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc12Q8R344 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc12Q8R344 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc12Q8R344 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc12Q8R344 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc12Q8R344 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc12Q8R344 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc12Q8R344 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc12Q8R344 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc12Q8R344 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc12Q8R344 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc12Q8R344 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc12Q8R344 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc12Q8R344 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc12Q8R344 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc12Q8R344 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc12Q8R344 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms