Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg10Q8R1P4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg10Q8R1P4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg10Q8R1P4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg10Q8R1P4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg10Q8R1P4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg10Q8R1P4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg10Q8R1P4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg10Q8R1P4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg10Q8R1P4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg10Q8R1P4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg10Q8R1P4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg10Q8R1P4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg10Q8R1P4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg10Q8R1P4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg10Q8R1P4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg10Q8R1P4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg10Q8R1P4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg10Q8R1P4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg10Q8R1P4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg10Q8R1P4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg10Q8R1P4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg10Q8R1P4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atg10Q8R1P4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atg10Q8R1P4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atg10Q8R1P4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atg10Q8R1P4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg10Q8R1P4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg10Q8R1P4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg10Q8R1P4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg10Q8R1P4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg10Q8R1P4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg10Q8R1P4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg10Q8R1P4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg10Q8R1P4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg10Q8R1P4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg10Q8R1P4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg10Q8R1P4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg10Q8R1P4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg10Q8R1P4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg10Q8R1P4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg10Q8R1P4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg10Q8R1P4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg10Q8R1P4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg10Q8R1P4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg10Q8R1P4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg10Q8R1P4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg10Q8R1P4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg10Q8R1P4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg10Q8R1P4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg10Q8R1P4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg10Q8R1P4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg10Q8R1P4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg10Q8R1P4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg10Q8R1P4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg10Q8R1P4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg10Q8R1P4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg10Q8R1P4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg10Q8R1P4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg10Q8R1P4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg10Q8R1P4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg10Q8R1P4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg10Q8R1P4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg10Q8R1P4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg10Q8R1P4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg10Q8R1P4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg10Q8R1P4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg10Q8R1P4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg10Q8R1P4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg10Q8R1P4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg10Q8R1P4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg10Q8R1P4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Atg10Q8R1P4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Atg10Q8R1P4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg10Q8R1P4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg10Q8R1P4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg10Q8R1P4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg10Q8R1P4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg10Q8R1P4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg10Q8R1P4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg10Q8R1P4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg10Q8R1P4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg10Q8R1P4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg10Q8R1P4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Atg10Q8R1P4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg10Q8R1P4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Atg10Q8R1P4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg10Q8R1P4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg10Q8R1P4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg10Q8R1P4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg10Q8R1P4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg10Q8R1P4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg10Q8R1P4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg10Q8R1P4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg10Q8R1P4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg10Q8R1P4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg10Q8R1P4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg10Q8R1P4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg10Q8R1P4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg10Q8R1P4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms