Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Hecw1Q8K4P8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Hecw1Q8K4P8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Hecw1Q8K4P8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Hecw1Q8K4P8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Hecw1Q8K4P8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Hecw1Q8K4P8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Hecw1Q8K4P8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Hecw1Q8K4P8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Hecw1Q8K4P8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Hecw1Q8K4P8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Hecw1Q8K4P8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Hecw1Q8K4P8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Hecw1Q8K4P8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Hecw1Q8K4P8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Hecw1Q8K4P8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Hecw1Q8K4P8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Hecw1Q8K4P8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Hecw1Q8K4P8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Hecw1Q8K4P8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Hecw1Q8K4P8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Hecw1Q8K4P8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Hecw1Q8K4P8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Hecw1Q8K4P8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Hecw1Q8K4P8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Hecw1Q8K4P8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Hecw1Q8K4P8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Hecw1Q8K4P8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Hecw1Q8K4P8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Hecw1Q8K4P8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Hecw1Q8K4P8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Hecw1Q8K4P8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Hecw1Q8K4P8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Hecw1Q8K4P8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Hecw1Q8K4P8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Hecw1Q8K4P8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Hecw1Q8K4P8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Hecw1Q8K4P8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Hecw1Q8K4P8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Hecw1Q8K4P8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Hecw1Q8K4P8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Hecw1Q8K4P8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Hecw1Q8K4P8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Hecw1Q8K4P8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Hecw1Q8K4P8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Hecw1Q8K4P8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Hecw1Q8K4P8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Hecw1Q8K4P8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Hecw1Q8K4P8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Hecw1Q8K4P8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Hecw1Q8K4P8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Hecw1Q8K4P8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Hecw1Q8K4P8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Hecw1Q8K4P8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Hecw1Q8K4P8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
Hecw1Q8K4P8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Hecw1Q8K4P8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
Hecw1Q8K4P8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Hecw1Q8K4P8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Hecw1Q8K4P8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Hecw1Q8K4P8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Hecw1Q8K4P8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Hecw1Q8K4P8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Hecw1Q8K4P8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Hecw1Q8K4P8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Hecw1Q8K4P8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Hecw1Q8K4P8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Hecw1Q8K4P8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Hecw1Q8K4P8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
Hecw1Q8K4P8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Hecw1Q8K4P8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Hecw1Q8K4P8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Hecw1Q8K4P8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Hecw1Q8K4P8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Hecw1Q8K4P8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Hecw1Q8K4P8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Hecw1Q8K4P8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Hecw1Q8K4P8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Hecw1Q8K4P8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Hecw1Q8K4P8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Hecw1Q8K4P8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Hecw1Q8K4P8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Hecw1Q8K4P8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Hecw1Q8K4P8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Hecw1Q8K4P8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Hecw1Q8K4P8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Hecw1Q8K4P8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Hecw1Q8K4P8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Hecw1Q8K4P8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Hecw1Q8K4P8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Hecw1Q8K4P8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Hecw1Q8K4P8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Hecw1Q8K4P8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Hecw1Q8K4P8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Hecw1Q8K4P8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Hecw1Q8K4P8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Hecw1Q8K4P8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Hecw1Q8K4P8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Hecw1Q8K4P8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Hecw1Q8K4P8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms