Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R3

Pnpt1, Polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpt1Q8K1R3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pnpt1Q8K1R3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pnpt1Q8K1R3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pnpt1Q8K1R3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pnpt1Q8K1R3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pnpt1Q8K1R3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pnpt1Q8K1R3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pnpt1Q8K1R3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pnpt1Q8K1R3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pnpt1Q8K1R3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pnpt1Q8K1R3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pnpt1Q8K1R3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pnpt1Q8K1R3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pnpt1Q8K1R3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pnpt1Q8K1R3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pnpt1Q8K1R3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pnpt1Q8K1R3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pnpt1Q8K1R3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pnpt1Q8K1R3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pnpt1Q8K1R3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pnpt1Q8K1R3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pnpt1Q8K1R3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pnpt1Q8K1R3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pnpt1Q8K1R3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pnpt1Q8K1R3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pnpt1Q8K1R3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pnpt1Q8K1R3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pnpt1Q8K1R3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pnpt1Q8K1R3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pnpt1Q8K1R3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pnpt1Q8K1R3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pnpt1Q8K1R3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pnpt1Q8K1R3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pnpt1Q8K1R3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pnpt1Q8K1R3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pnpt1Q8K1R3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pnpt1Q8K1R3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pnpt1Q8K1R3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pnpt1Q8K1R3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pnpt1Q8K1R3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pnpt1Q8K1R3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms