Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGP2

Hist1h2bp, Histone H2B type 1-P, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist1h2bpQ8CGP2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hist1h2bpQ8CGP2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hist1h2bpQ8CGP2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hist1h2bpQ8CGP2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hist1h2bpQ8CGP2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hist1h2bpQ8CGP2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hist1h2bpQ8CGP2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hist1h2bpQ8CGP2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hist1h2bpQ8CGP2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hist1h2bpQ8CGP2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hist1h2bpQ8CGP2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hist1h2bpQ8CGP2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hist1h2bpQ8CGP2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hist1h2bpQ8CGP2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hist1h2bpQ8CGP2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hist1h2bpQ8CGP2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hist1h2bpQ8CGP2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hist1h2bpQ8CGP2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hist1h2bpQ8CGP2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hist1h2bpQ8CGP2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hist1h2bpQ8CGP2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hist1h2bpQ8CGP2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hist1h2bpQ8CGP2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hist1h2bpQ8CGP2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hist1h2bpQ8CGP2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hist1h2bpQ8CGP2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hist1h2bpQ8CGP2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hist1h2bpQ8CGP2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hist1h2bpQ8CGP2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hist1h2bpQ8CGP2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hist1h2bpQ8CGP2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms