Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc28aQ8CEI3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc28aQ8CEI3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc28aQ8CEI3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc28aQ8CEI3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc28aQ8CEI3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc28aQ8CEI3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc28aQ8CEI3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc28aQ8CEI3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc28aQ8CEI3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc28aQ8CEI3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc28aQ8CEI3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc28aQ8CEI3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc28aQ8CEI3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc28aQ8CEI3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc28aQ8CEI3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc28aQ8CEI3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc28aQ8CEI3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc28aQ8CEI3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc28aQ8CEI3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc28aQ8CEI3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc28aQ8CEI3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc28aQ8CEI3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc28aQ8CEI3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc28aQ8CEI3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc28aQ8CEI3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc28aQ8CEI3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc28aQ8CEI3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc28aQ8CEI3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc28aQ8CEI3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc28aQ8CEI3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc28aQ8CEI3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc28aQ8CEI3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc28aQ8CEI3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc28aQ8CEI3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc28aQ8CEI3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc28aQ8CEI3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc28aQ8CEI3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc28aQ8CEI3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc28aQ8CEI3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc28aQ8CEI3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc28aQ8CEI3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc28aQ8CEI3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc28aQ8CEI3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc28aQ8CEI3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc28aQ8CEI3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc28aQ8CEI3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc28aQ8CEI3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc28aQ8CEI3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc28aQ8CEI3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc28aQ8CEI3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc28aQ8CEI3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc28aQ8CEI3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc28aQ8CEI3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc28aQ8CEI3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc28aQ8CEI3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc28aQ8CEI3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc28aQ8CEI3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc28aQ8CEI3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc28aQ8CEI3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc28aQ8CEI3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc28aQ8CEI3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc28aQ8CEI3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc28aQ8CEI3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc28aQ8CEI3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc28aQ8CEI3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc28aQ8CEI3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc28aQ8CEI3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc28aQ8CEI3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc28aQ8CEI3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc28aQ8CEI3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc28aQ8CEI3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc28aQ8CEI3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc28aQ8CEI3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc28aQ8CEI3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc28aQ8CEI3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc28aQ8CEI3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc28aQ8CEI3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc28aQ8CEI3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc28aQ8CEI3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc28aQ8CEI3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc28aQ8CEI3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc28aQ8CEI3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc28aQ8CEI3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc28aQ8CEI3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc28aQ8CEI3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc28aQ8CEI3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc28aQ8CEI3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc28aQ8CEI3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms