Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDW1

Fam228a, Protein FAM228A, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228aQ8CDW1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam228aQ8CDW1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam228aQ8CDW1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam228aQ8CDW1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam228aQ8CDW1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam228aQ8CDW1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam228aQ8CDW1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam228aQ8CDW1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam228aQ8CDW1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam228aQ8CDW1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam228aQ8CDW1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam228aQ8CDW1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam228aQ8CDW1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam228aQ8CDW1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam228aQ8CDW1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam228aQ8CDW1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam228aQ8CDW1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam228aQ8CDW1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam228aQ8CDW1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam228aQ8CDW1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam228aQ8CDW1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam228aQ8CDW1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam228aQ8CDW1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam228aQ8CDW1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam228aQ8CDW1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam228aQ8CDW1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam228aQ8CDW1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam228aQ8CDW1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam228aQ8CDW1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam228aQ8CDW1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam228aQ8CDW1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam228aQ8CDW1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam228aQ8CDW1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam228aQ8CDW1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Fam228aQ8CDW1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Fam228aQ8CDW1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam228aQ8CDW1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam228aQ8CDW1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam228aQ8CDW1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam228aQ8CDW1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam228aQ8CDW1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam228aQ8CDW1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam228aQ8CDW1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam228aQ8CDW1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam228aQ8CDW1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam228aQ8CDW1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam228aQ8CDW1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam228aQ8CDW1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam228aQ8CDW1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fam228aQ8CDW1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam228aQ8CDW1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam228aQ8CDW1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam228aQ8CDW1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Fam228aQ8CDW1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam228aQ8CDW1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fam228aQ8CDW1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam228aQ8CDW1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam228aQ8CDW1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam228aQ8CDW1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam228aQ8CDW1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam228aQ8CDW1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam228aQ8CDW1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam228aQ8CDW1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam228aQ8CDW1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam228aQ8CDW1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam228aQ8CDW1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam228aQ8CDW1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam228aQ8CDW1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam228aQ8CDW1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam228aQ8CDW1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam228aQ8CDW1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam228aQ8CDW1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam228aQ8CDW1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam228aQ8CDW1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam228aQ8CDW1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam228aQ8CDW1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam228aQ8CDW1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam228aQ8CDW1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam228aQ8CDW1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam228aQ8CDW1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam228aQ8CDW1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam228aQ8CDW1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam228aQ8CDW1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam228aQ8CDW1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Fam228aQ8CDW1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam228aQ8CDW1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam228aQ8CDW1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam228aQ8CDW1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam228aQ8CDW1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam228aQ8CDW1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam228aQ8CDW1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam228aQ8CDW1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam228aQ8CDW1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam228aQ8CDW1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam228aQ8CDW1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam228aQ8CDW1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam228aQ8CDW1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam228aQ8CDW1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam228aQ8CDW1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam228aQ8CDW1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms