Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDR2

Rsph6a, Radial spoke head protein 6 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph6aQ8CDR2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rsph6aQ8CDR2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rsph6aQ8CDR2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rsph6aQ8CDR2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rsph6aQ8CDR2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rsph6aQ8CDR2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rsph6aQ8CDR2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rsph6aQ8CDR2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rsph6aQ8CDR2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rsph6aQ8CDR2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rsph6aQ8CDR2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rsph6aQ8CDR2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rsph6aQ8CDR2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rsph6aQ8CDR2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rsph6aQ8CDR2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rsph6aQ8CDR2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rsph6aQ8CDR2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rsph6aQ8CDR2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rsph6aQ8CDR2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Rsph6aQ8CDR2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rsph6aQ8CDR2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rsph6aQ8CDR2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rsph6aQ8CDR2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rsph6aQ8CDR2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rsph6aQ8CDR2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rsph6aQ8CDR2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rsph6aQ8CDR2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rsph6aQ8CDR2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Rsph6aQ8CDR2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rsph6aQ8CDR2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rsph6aQ8CDR2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rsph6aQ8CDR2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rsph6aQ8CDR2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rsph6aQ8CDR2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Rsph6aQ8CDR2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rsph6aQ8CDR2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rsph6aQ8CDR2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rsph6aQ8CDR2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rsph6aQ8CDR2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rsph6aQ8CDR2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rsph6aQ8CDR2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rsph6aQ8CDR2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rsph6aQ8CDR2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rsph6aQ8CDR2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rsph6aQ8CDR2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rsph6aQ8CDR2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rsph6aQ8CDR2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rsph6aQ8CDR2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rsph6aQ8CDR2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rsph6aQ8CDR2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Rsph6aQ8CDR2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rsph6aQ8CDR2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rsph6aQ8CDR2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rsph6aQ8CDR2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rsph6aQ8CDR2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rsph6aQ8CDR2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rsph6aQ8CDR2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rsph6aQ8CDR2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rsph6aQ8CDR2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rsph6aQ8CDR2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rsph6aQ8CDR2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rsph6aQ8CDR2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rsph6aQ8CDR2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rsph6aQ8CDR2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rsph6aQ8CDR2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rsph6aQ8CDR2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rsph6aQ8CDR2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rsph6aQ8CDR2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Rsph6aQ8CDR2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rsph6aQ8CDR2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rsph6aQ8CDR2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rsph6aQ8CDR2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rsph6aQ8CDR2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rsph6aQ8CDR2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rsph6aQ8CDR2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rsph6aQ8CDR2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rsph6aQ8CDR2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rsph6aQ8CDR2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rsph6aQ8CDR2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rsph6aQ8CDR2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rsph6aQ8CDR2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rsph6aQ8CDR2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rsph6aQ8CDR2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rsph6aQ8CDR2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rsph6aQ8CDR2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rsph6aQ8CDR2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rsph6aQ8CDR2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rsph6aQ8CDR2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rsph6aQ8CDR2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Rsph6aQ8CDR2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rsph6aQ8CDR2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rsph6aQ8CDR2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rsph6aQ8CDR2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rsph6aQ8CDR2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Rsph6aQ8CDR2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rsph6aQ8CDR2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rsph6aQ8CDR2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rsph6aQ8CDR2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rsph6aQ8CDR2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Rsph6aQ8CDR2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.5 ms