Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Lrrc9Q8CDN9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Lrrc9Q8CDN9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Lrrc9Q8CDN9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Lrrc9Q8CDN9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Lrrc9Q8CDN9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Lrrc9Q8CDN9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Lrrc9Q8CDN9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Lrrc9Q8CDN9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Lrrc9Q8CDN9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Lrrc9Q8CDN9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Lrrc9Q8CDN9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Lrrc9Q8CDN9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Lrrc9Q8CDN9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Lrrc9Q8CDN9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Lrrc9Q8CDN9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Lrrc9Q8CDN9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Lrrc9Q8CDN9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Lrrc9Q8CDN9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Lrrc9Q8CDN9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Lrrc9Q8CDN9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Lrrc9Q8CDN9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Lrrc9Q8CDN9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Lrrc9Q8CDN9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Lrrc9Q8CDN9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Lrrc9Q8CDN9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Lrrc9Q8CDN9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Lrrc9Q8CDN9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Lrrc9Q8CDN9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Lrrc9Q8CDN9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Lrrc9Q8CDN9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Lrrc9Q8CDN9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Lrrc9Q8CDN9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Lrrc9Q8CDN9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Lrrc9Q8CDN9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Lrrc9Q8CDN9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Lrrc9Q8CDN9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Lrrc9Q8CDN9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Lrrc9Q8CDN9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Lrrc9Q8CDN9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Lrrc9Q8CDN9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Lrrc9Q8CDN9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Lrrc9Q8CDN9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Lrrc9Q8CDN9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Lrrc9Q8CDN9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Lrrc9Q8CDN9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Lrrc9Q8CDN9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Lrrc9Q8CDN9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Lrrc9Q8CDN9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Lrrc9Q8CDN9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Lrrc9Q8CDN9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Lrrc9Q8CDN9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Lrrc9Q8CDN9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Lrrc9Q8CDN9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Lrrc9Q8CDN9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Lrrc9Q8CDN9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Lrrc9Q8CDN9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Lrrc9Q8CDN9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Lrrc9Q8CDN9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Lrrc9Q8CDN9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Lrrc9Q8CDN9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Lrrc9Q8CDN9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Lrrc9Q8CDN9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Lrrc9Q8CDN9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Lrrc9Q8CDN9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Lrrc9Q8CDN9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Lrrc9Q8CDN9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Lrrc9Q8CDN9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Lrrc9Q8CDN9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Lrrc9Q8CDN9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Lrrc9Q8CDN9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Lrrc9Q8CDN9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Lrrc9Q8CDN9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Lrrc9Q8CDN9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Lrrc9Q8CDN9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Lrrc9Q8CDN9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Lrrc9Q8CDN9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Lrrc9Q8CDN9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Lrrc9Q8CDN9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Lrrc9Q8CDN9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Lrrc9Q8CDN9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Lrrc9Q8CDN9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Lrrc9Q8CDN9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Lrrc9Q8CDN9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Lrrc9Q8CDN9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Lrrc9Q8CDN9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Lrrc9Q8CDN9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Lrrc9Q8CDN9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Lrrc9Q8CDN9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Lrrc9Q8CDN9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Lrrc9Q8CDN9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Lrrc9Q8CDN9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Lrrc9Q8CDN9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Lrrc9Q8CDN9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Lrrc9Q8CDN9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Lrrc9Q8CDN9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Lrrc9Q8CDN9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Lrrc9Q8CDN9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Lrrc9Q8CDN9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Lrrc9Q8CDN9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms