Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
E4f1Q8CCE9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
E4f1Q8CCE9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
E4f1Q8CCE9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
E4f1Q8CCE9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
E4f1Q8CCE9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
E4f1Q8CCE9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
E4f1Q8CCE9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
E4f1Q8CCE9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
E4f1Q8CCE9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
E4f1Q8CCE9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
E4f1Q8CCE9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
E4f1Q8CCE9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
E4f1Q8CCE9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
E4f1Q8CCE9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
E4f1Q8CCE9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
E4f1Q8CCE9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
E4f1Q8CCE9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
E4f1Q8CCE9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
E4f1Q8CCE9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
E4f1Q8CCE9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
E4f1Q8CCE9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
E4f1Q8CCE9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
E4f1Q8CCE9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
E4f1Q8CCE9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
E4f1Q8CCE9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
E4f1Q8CCE9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
E4f1Q8CCE9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
E4f1Q8CCE9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
E4f1Q8CCE9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
E4f1Q8CCE9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
E4f1Q8CCE9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
E4f1Q8CCE9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
E4f1Q8CCE9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
E4f1Q8CCE9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
E4f1Q8CCE9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
E4f1Q8CCE9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
E4f1Q8CCE9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
E4f1Q8CCE9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
E4f1Q8CCE9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
E4f1Q8CCE9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
E4f1Q8CCE9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
E4f1Q8CCE9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
E4f1Q8CCE9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
E4f1Q8CCE9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
E4f1Q8CCE9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
E4f1Q8CCE9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
E4f1Q8CCE9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
E4f1Q8CCE9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
E4f1Q8CCE9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
E4f1Q8CCE9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
E4f1Q8CCE9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
E4f1Q8CCE9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
E4f1Q8CCE9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
E4f1Q8CCE9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
E4f1Q8CCE9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
E4f1Q8CCE9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
E4f1Q8CCE9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
E4f1Q8CCE9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
E4f1Q8CCE9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
E4f1Q8CCE9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
E4f1Q8CCE9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
E4f1Q8CCE9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
E4f1Q8CCE9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
E4f1Q8CCE9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
E4f1Q8CCE9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
E4f1Q8CCE9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
E4f1Q8CCE9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
E4f1Q8CCE9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
E4f1Q8CCE9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
E4f1Q8CCE9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
E4f1Q8CCE9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
E4f1Q8CCE9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
E4f1Q8CCE9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
E4f1Q8CCE9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
E4f1Q8CCE9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
E4f1Q8CCE9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
E4f1Q8CCE9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
E4f1Q8CCE9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
E4f1Q8CCE9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
E4f1Q8CCE9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
E4f1Q8CCE9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
E4f1Q8CCE9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
E4f1Q8CCE9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
E4f1Q8CCE9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
E4f1Q8CCE9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
E4f1Q8CCE9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
E4f1Q8CCE9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
E4f1Q8CCE9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
E4f1Q8CCE9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
E4f1Q8CCE9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
E4f1Q8CCE9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
E4f1Q8CCE9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
E4f1Q8CCE9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
E4f1Q8CCE9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
E4f1Q8CCE9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
E4f1Q8CCE9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
E4f1Q8CCE9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
E4f1Q8CCE9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
E4f1Q8CCE9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.4 ms