Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8B0

Alx1, ALX homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx1Q8C8B0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Alx1Q8C8B0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Alx1Q8C8B0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Alx1Q8C8B0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Alx1Q8C8B0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Alx1Q8C8B0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Alx1Q8C8B0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Alx1Q8C8B0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Alx1Q8C8B0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Alx1Q8C8B0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Alx1Q8C8B0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Alx1Q8C8B0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Alx1Q8C8B0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Alx1Q8C8B0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Alx1Q8C8B0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Alx1Q8C8B0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Alx1Q8C8B0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Alx1Q8C8B0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Alx1Q8C8B0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Alx1Q8C8B0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Alx1Q8C8B0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Alx1Q8C8B0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Alx1Q8C8B0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Alx1Q8C8B0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Alx1Q8C8B0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Alx1Q8C8B0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Alx1Q8C8B0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Alx1Q8C8B0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Alx1Q8C8B0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Alx1Q8C8B0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Alx1Q8C8B0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Alx1Q8C8B0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Alx1Q8C8B0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Alx1Q8C8B0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Alx1Q8C8B0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Alx1Q8C8B0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Alx1Q8C8B0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Alx1Q8C8B0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Alx1Q8C8B0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Alx1Q8C8B0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Alx1Q8C8B0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Alx1Q8C8B0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Alx1Q8C8B0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Alx1Q8C8B0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Alx1Q8C8B0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Alx1Q8C8B0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Alx1Q8C8B0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Alx1Q8C8B0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Alx1Q8C8B0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Alx1Q8C8B0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Alx1Q8C8B0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Alx1Q8C8B0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Alx1Q8C8B0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Alx1Q8C8B0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Alx1Q8C8B0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Alx1Q8C8B0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Alx1Q8C8B0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Alx1Q8C8B0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Alx1Q8C8B0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Alx1Q8C8B0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Alx1Q8C8B0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Alx1Q8C8B0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Alx1Q8C8B0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Alx1Q8C8B0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Alx1Q8C8B0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Alx1Q8C8B0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Alx1Q8C8B0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Alx1Q8C8B0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Alx1Q8C8B0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Alx1Q8C8B0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Alx1Q8C8B0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Alx1Q8C8B0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Alx1Q8C8B0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Alx1Q8C8B0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Alx1Q8C8B0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Alx1Q8C8B0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Alx1Q8C8B0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Alx1Q8C8B0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Alx1Q8C8B0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Alx1Q8C8B0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Alx1Q8C8B0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Alx1Q8C8B0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Alx1Q8C8B0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Alx1Q8C8B0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Alx1Q8C8B0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Alx1Q8C8B0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Alx1Q8C8B0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Alx1Q8C8B0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Alx1Q8C8B0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Alx1Q8C8B0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Alx1Q8C8B0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Alx1Q8C8B0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Alx1Q8C8B0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Alx1Q8C8B0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Alx1Q8C8B0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Alx1Q8C8B0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Alx1Q8C8B0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Alx1Q8C8B0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Alx1Q8C8B0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Alx1Q8C8B0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms