Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sfrp1Q8C4U3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sfrp1Q8C4U3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sfrp1Q8C4U3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sfrp1Q8C4U3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Sfrp1Q8C4U3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sfrp1Q8C4U3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sfrp1Q8C4U3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sfrp1Q8C4U3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Sfrp1Q8C4U3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sfrp1Q8C4U3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sfrp1Q8C4U3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sfrp1Q8C4U3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sfrp1Q8C4U3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sfrp1Q8C4U3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sfrp1Q8C4U3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sfrp1Q8C4U3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sfrp1Q8C4U3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sfrp1Q8C4U3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sfrp1Q8C4U3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sfrp1Q8C4U3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sfrp1Q8C4U3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sfrp1Q8C4U3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sfrp1Q8C4U3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sfrp1Q8C4U3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sfrp1Q8C4U3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sfrp1Q8C4U3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sfrp1Q8C4U3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sfrp1Q8C4U3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sfrp1Q8C4U3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Sfrp1Q8C4U3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sfrp1Q8C4U3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sfrp1Q8C4U3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sfrp1Q8C4U3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sfrp1Q8C4U3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sfrp1Q8C4U3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sfrp1Q8C4U3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sfrp1Q8C4U3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sfrp1Q8C4U3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sfrp1Q8C4U3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Sfrp1Q8C4U3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sfrp1Q8C4U3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sfrp1Q8C4U3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sfrp1Q8C4U3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sfrp1Q8C4U3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Sfrp1Q8C4U3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sfrp1Q8C4U3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sfrp1Q8C4U3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sfrp1Q8C4U3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sfrp1Q8C4U3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sfrp1Q8C4U3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sfrp1Q8C4U3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sfrp1Q8C4U3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sfrp1Q8C4U3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sfrp1Q8C4U3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sfrp1Q8C4U3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sfrp1Q8C4U3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sfrp1Q8C4U3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sfrp1Q8C4U3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sfrp1Q8C4U3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sfrp1Q8C4U3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sfrp1Q8C4U3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sfrp1Q8C4U3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sfrp1Q8C4U3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sfrp1Q8C4U3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sfrp1Q8C4U3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sfrp1Q8C4U3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sfrp1Q8C4U3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sfrp1Q8C4U3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Sfrp1Q8C4U3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sfrp1Q8C4U3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sfrp1Q8C4U3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sfrp1Q8C4U3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sfrp1Q8C4U3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sfrp1Q8C4U3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sfrp1Q8C4U3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sfrp1Q8C4U3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Sfrp1Q8C4U3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sfrp1Q8C4U3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sfrp1Q8C4U3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sfrp1Q8C4U3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sfrp1Q8C4U3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sfrp1Q8C4U3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sfrp1Q8C4U3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sfrp1Q8C4U3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sfrp1Q8C4U3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sfrp1Q8C4U3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sfrp1Q8C4U3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sfrp1Q8C4U3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sfrp1Q8C4U3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sfrp1Q8C4U3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sfrp1Q8C4U3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sfrp1Q8C4U3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Sfrp1Q8C4U3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sfrp1Q8C4U3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sfrp1Q8C4U3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Sfrp1Q8C4U3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sfrp1Q8C4U3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Sfrp1Q8C4U3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Sfrp1Q8C4U3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms