Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc30Q8BVF4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc30Q8BVF4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc30Q8BVF4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc30Q8BVF4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc30Q8BVF4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc30Q8BVF4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc30Q8BVF4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc30Q8BVF4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc30Q8BVF4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc30Q8BVF4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc30Q8BVF4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc30Q8BVF4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc30Q8BVF4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc30Q8BVF4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc30Q8BVF4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc30Q8BVF4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc30Q8BVF4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc30Q8BVF4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc30Q8BVF4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc30Q8BVF4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc30Q8BVF4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc30Q8BVF4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc30Q8BVF4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc30Q8BVF4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc30Q8BVF4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc30Q8BVF4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc30Q8BVF4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc30Q8BVF4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc30Q8BVF4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc30Q8BVF4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc30Q8BVF4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc30Q8BVF4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc30Q8BVF4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc30Q8BVF4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc30Q8BVF4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc30Q8BVF4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc30Q8BVF4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc30Q8BVF4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc30Q8BVF4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc30Q8BVF4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc30Q8BVF4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc30Q8BVF4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc30Q8BVF4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc30Q8BVF4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc30Q8BVF4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc30Q8BVF4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc30Q8BVF4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc30Q8BVF4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Ccdc30Q8BVF4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc30Q8BVF4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc30Q8BVF4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc30Q8BVF4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc30Q8BVF4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc30Q8BVF4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc30Q8BVF4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc30Q8BVF4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc30Q8BVF4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc30Q8BVF4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc30Q8BVF4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc30Q8BVF4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc30Q8BVF4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc30Q8BVF4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc30Q8BVF4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc30Q8BVF4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc30Q8BVF4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc30Q8BVF4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc30Q8BVF4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc30Q8BVF4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc30Q8BVF4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc30Q8BVF4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc30Q8BVF4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc30Q8BVF4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc30Q8BVF4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc30Q8BVF4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc30Q8BVF4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc30Q8BVF4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc30Q8BVF4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc30Q8BVF4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc30Q8BVF4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc30Q8BVF4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc30Q8BVF4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc30Q8BVF4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc30Q8BVF4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc30Q8BVF4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc30Q8BVF4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc30Q8BVF4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc30Q8BVF4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc30Q8BVF4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc30Q8BVF4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc30Q8BVF4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc30Q8BVF4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc30Q8BVF4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc30Q8BVF4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc30Q8BVF4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc30Q8BVF4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc30Q8BVF4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc30Q8BVF4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc30Q8BVF4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc30Q8BVF4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms