Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grik4Q8BMF5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grik4Q8BMF5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grik4Q8BMF5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grik4Q8BMF5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grik4Q8BMF5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grik4Q8BMF5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grik4Q8BMF5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grik4Q8BMF5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grik4Q8BMF5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grik4Q8BMF5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grik4Q8BMF5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grik4Q8BMF5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grik4Q8BMF5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Grik4Q8BMF5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Grik4Q8BMF5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Grik4Q8BMF5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Grik4Q8BMF5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Grik4Q8BMF5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Grik4Q8BMF5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Grik4Q8BMF5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Grik4Q8BMF5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Grik4Q8BMF5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Grik4Q8BMF5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Grik4Q8BMF5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Grik4Q8BMF5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Grik4Q8BMF5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Grik4Q8BMF5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Grik4Q8BMF5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Grik4Q8BMF5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Grik4Q8BMF5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Grik4Q8BMF5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Grik4Q8BMF5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grik4Q8BMF5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grik4Q8BMF5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grik4Q8BMF5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grik4Q8BMF5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grik4Q8BMF5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grik4Q8BMF5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Grik4Q8BMF5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Grik4Q8BMF5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Grik4Q8BMF5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Grik4Q8BMF5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Grik4Q8BMF5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Grik4Q8BMF5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Grik4Q8BMF5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Grik4Q8BMF5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Grik4Q8BMF5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Grik4Q8BMF5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Grik4Q8BMF5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Grik4Q8BMF5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Grik4Q8BMF5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Grik4Q8BMF5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Grik4Q8BMF5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Grik4Q8BMF5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Grik4Q8BMF5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Grik4Q8BMF5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Grik4Q8BMF5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Grik4Q8BMF5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Grik4Q8BMF5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Grik4Q8BMF5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Grik4Q8BMF5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Grik4Q8BMF5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Grik4Q8BMF5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Grik4Q8BMF5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grik4Q8BMF5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grik4Q8BMF5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grik4Q8BMF5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grik4Q8BMF5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grik4Q8BMF5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grik4Q8BMF5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grik4Q8BMF5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grik4Q8BMF5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grik4Q8BMF5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grik4Q8BMF5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Grik4Q8BMF5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Grik4Q8BMF5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Grik4Q8BMF5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Grik4Q8BMF5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Grik4Q8BMF5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Grik4Q8BMF5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Grik4Q8BMF5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Grik4Q8BMF5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Grik4Q8BMF5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Grik4Q8BMF5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Grik4Q8BMF5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Grik4Q8BMF5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Grik4Q8BMF5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Grik4Q8BMF5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Grik4Q8BMF5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Grik4Q8BMF5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Grik4Q8BMF5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Grik4Q8BMF5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Grik4Q8BMF5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Grik4Q8BMF5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Grik4Q8BMF5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Grik4Q8BMF5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Grik4Q8BMF5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Grik4Q8BMF5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Grik4Q8BMF5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms