Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLA8

Trpa1, Transient receptor potential cation channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpa1Q8BLA8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpa1Q8BLA8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpa1Q8BLA8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpa1Q8BLA8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpa1Q8BLA8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpa1Q8BLA8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpa1Q8BLA8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpa1Q8BLA8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpa1Q8BLA8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpa1Q8BLA8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpa1Q8BLA8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpa1Q8BLA8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpa1Q8BLA8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpa1Q8BLA8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpa1Q8BLA8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpa1Q8BLA8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpa1Q8BLA8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpa1Q8BLA8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpa1Q8BLA8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpa1Q8BLA8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpa1Q8BLA8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpa1Q8BLA8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpa1Q8BLA8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpa1Q8BLA8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpa1Q8BLA8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpa1Q8BLA8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpa1Q8BLA8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpa1Q8BLA8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpa1Q8BLA8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpa1Q8BLA8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpa1Q8BLA8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpa1Q8BLA8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpa1Q8BLA8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpa1Q8BLA8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpa1Q8BLA8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpa1Q8BLA8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpa1Q8BLA8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpa1Q8BLA8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpa1Q8BLA8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpa1Q8BLA8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpa1Q8BLA8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpa1Q8BLA8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpa1Q8BLA8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpa1Q8BLA8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpa1Q8BLA8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpa1Q8BLA8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpa1Q8BLA8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpa1Q8BLA8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpa1Q8BLA8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpa1Q8BLA8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpa1Q8BLA8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpa1Q8BLA8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpa1Q8BLA8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpa1Q8BLA8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpa1Q8BLA8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpa1Q8BLA8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpa1Q8BLA8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpa1Q8BLA8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpa1Q8BLA8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpa1Q8BLA8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpa1Q8BLA8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpa1Q8BLA8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpa1Q8BLA8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpa1Q8BLA8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpa1Q8BLA8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpa1Q8BLA8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpa1Q8BLA8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpa1Q8BLA8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpa1Q8BLA8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpa1Q8BLA8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpa1Q8BLA8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpa1Q8BLA8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpa1Q8BLA8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpa1Q8BLA8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpa1Q8BLA8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpa1Q8BLA8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpa1Q8BLA8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpa1Q8BLA8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpa1Q8BLA8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpa1Q8BLA8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpa1Q8BLA8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpa1Q8BLA8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpa1Q8BLA8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpa1Q8BLA8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpa1Q8BLA8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpa1Q8BLA8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpa1Q8BLA8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpa1Q8BLA8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpa1Q8BLA8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpa1Q8BLA8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpa1Q8BLA8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpa1Q8BLA8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trpa1Q8BLA8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trpa1Q8BLA8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trpa1Q8BLA8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trpa1Q8BLA8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trpa1Q8BLA8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trpa1Q8BLA8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trpa1Q8BLA8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trpa1Q8BLA8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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