Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tnrc6bQ8BKI2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tnrc6bQ8BKI2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tnrc6bQ8BKI2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tnrc6bQ8BKI2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tnrc6bQ8BKI2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tnrc6bQ8BKI2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tnrc6bQ8BKI2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tnrc6bQ8BKI2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tnrc6bQ8BKI2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tnrc6bQ8BKI2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tnrc6bQ8BKI2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tnrc6bQ8BKI2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tnrc6bQ8BKI2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tnrc6bQ8BKI2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tnrc6bQ8BKI2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tnrc6bQ8BKI2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tnrc6bQ8BKI2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tnrc6bQ8BKI2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Tnrc6bQ8BKI2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Tnrc6bQ8BKI2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tnrc6bQ8BKI2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tnrc6bQ8BKI2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tnrc6bQ8BKI2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tnrc6bQ8BKI2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tnrc6bQ8BKI2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tnrc6bQ8BKI2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tnrc6bQ8BKI2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tnrc6bQ8BKI2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tnrc6bQ8BKI2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tnrc6bQ8BKI2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Tnrc6bQ8BKI2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tnrc6bQ8BKI2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tnrc6bQ8BKI2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tnrc6bQ8BKI2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tnrc6bQ8BKI2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tnrc6bQ8BKI2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tnrc6bQ8BKI2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tnrc6bQ8BKI2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tnrc6bQ8BKI2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tnrc6bQ8BKI2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tnrc6bQ8BKI2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tnrc6bQ8BKI2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tnrc6bQ8BKI2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tnrc6bQ8BKI2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tnrc6bQ8BKI2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tnrc6bQ8BKI2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tnrc6bQ8BKI2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tnrc6bQ8BKI2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tnrc6bQ8BKI2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tnrc6bQ8BKI2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tnrc6bQ8BKI2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Tnrc6bQ8BKI2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Tnrc6bQ8BKI2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tnrc6bQ8BKI2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Tnrc6bQ8BKI2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Tnrc6bQ8BKI2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Tnrc6bQ8BKI2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tnrc6bQ8BKI2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tnrc6bQ8BKI2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Tnrc6bQ8BKI2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Tnrc6bQ8BKI2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tnrc6bQ8BKI2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tnrc6bQ8BKI2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tnrc6bQ8BKI2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tnrc6bQ8BKI2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tnrc6bQ8BKI2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tnrc6bQ8BKI2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Tnrc6bQ8BKI2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tnrc6bQ8BKI2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tnrc6bQ8BKI2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tnrc6bQ8BKI2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tnrc6bQ8BKI2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tnrc6bQ8BKI2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tnrc6bQ8BKI2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tnrc6bQ8BKI2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tnrc6bQ8BKI2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tnrc6bQ8BKI2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tnrc6bQ8BKI2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tnrc6bQ8BKI2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tnrc6bQ8BKI2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tnrc6bQ8BKI2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tnrc6bQ8BKI2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tnrc6bQ8BKI2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tnrc6bQ8BKI2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Tnrc6bQ8BKI2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tnrc6bQ8BKI2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tnrc6bQ8BKI2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tnrc6bQ8BKI2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms