Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nop53Q8BK35 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nop53Q8BK35 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nop53Q8BK35 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nop53Q8BK35 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nop53Q8BK35 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nop53Q8BK35 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nop53Q8BK35 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nop53Q8BK35 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nop53Q8BK35 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nop53Q8BK35 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nop53Q8BK35 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nop53Q8BK35 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nop53Q8BK35 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nop53Q8BK35 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nop53Q8BK35 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nop53Q8BK35 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nop53Q8BK35 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nop53Q8BK35 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nop53Q8BK35 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nop53Q8BK35 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nop53Q8BK35 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nop53Q8BK35 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nop53Q8BK35 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nop53Q8BK35 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nop53Q8BK35 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nop53Q8BK35 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nop53Q8BK35 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nop53Q8BK35 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nop53Q8BK35 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nop53Q8BK35 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nop53Q8BK35 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nop53Q8BK35 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nop53Q8BK35 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nop53Q8BK35 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nop53Q8BK35 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nop53Q8BK35 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nop53Q8BK35 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nop53Q8BK35 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nop53Q8BK35 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nop53Q8BK35 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nop53Q8BK35 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nop53Q8BK35 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nop53Q8BK35 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nop53Q8BK35 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nop53Q8BK35 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nop53Q8BK35 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nop53Q8BK35 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nop53Q8BK35 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nop53Q8BK35 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nop53Q8BK35 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nop53Q8BK35 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nop53Q8BK35 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nop53Q8BK35 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nop53Q8BK35 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nop53Q8BK35 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nop53Q8BK35 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nop53Q8BK35 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nop53Q8BK35 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nop53Q8BK35 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nop53Q8BK35 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nop53Q8BK35 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nop53Q8BK35 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nop53Q8BK35 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nop53Q8BK35 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nop53Q8BK35 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nop53Q8BK35 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nop53Q8BK35 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nop53Q8BK35 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nop53Q8BK35 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nop53Q8BK35 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nop53Q8BK35 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nop53Q8BK35 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nop53Q8BK35 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nop53Q8BK35 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nop53Q8BK35 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nop53Q8BK35 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nop53Q8BK35 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nop53Q8BK35 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Nop53Q8BK35 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nop53Q8BK35 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nop53Q8BK35 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nop53Q8BK35 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nop53Q8BK35 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nop53Q8BK35 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nop53Q8BK35 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nop53Q8BK35 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nop53Q8BK35 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nop53Q8BK35 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nop53Q8BK35 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nop53Q8BK35 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nop53Q8BK35 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nop53Q8BK35 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nop53Q8BK35 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nop53Q8BK35 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nop53Q8BK35 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nop53Q8BK35 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nop53Q8BK35 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nop53Q8BK35 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nop53Q8BK35 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms