Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cyp4f39Q8BGU0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cyp4f39Q8BGU0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cyp4f39Q8BGU0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cyp4f39Q8BGU0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cyp4f39Q8BGU0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cyp4f39Q8BGU0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp4f39Q8BGU0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp4f39Q8BGU0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp4f39Q8BGU0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp4f39Q8BGU0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cyp4f39Q8BGU0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cyp4f39Q8BGU0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cyp4f39Q8BGU0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyp4f39Q8BGU0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyp4f39Q8BGU0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyp4f39Q8BGU0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyp4f39Q8BGU0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyp4f39Q8BGU0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyp4f39Q8BGU0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyp4f39Q8BGU0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyp4f39Q8BGU0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyp4f39Q8BGU0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyp4f39Q8BGU0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyp4f39Q8BGU0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cyp4f39Q8BGU0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyp4f39Q8BGU0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyp4f39Q8BGU0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyp4f39Q8BGU0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyp4f39Q8BGU0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyp4f39Q8BGU0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyp4f39Q8BGU0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyp4f39Q8BGU0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyp4f39Q8BGU0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyp4f39Q8BGU0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyp4f39Q8BGU0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyp4f39Q8BGU0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyp4f39Q8BGU0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyp4f39Q8BGU0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyp4f39Q8BGU0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyp4f39Q8BGU0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyp4f39Q8BGU0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyp4f39Q8BGU0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyp4f39Q8BGU0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyp4f39Q8BGU0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyp4f39Q8BGU0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyp4f39Q8BGU0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyp4f39Q8BGU0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyp4f39Q8BGU0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyp4f39Q8BGU0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cyp4f39Q8BGU0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyp4f39Q8BGU0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyp4f39Q8BGU0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyp4f39Q8BGU0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyp4f39Q8BGU0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyp4f39Q8BGU0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyp4f39Q8BGU0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cyp4f39Q8BGU0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cyp4f39Q8BGU0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cyp4f39Q8BGU0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cyp4f39Q8BGU0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cyp4f39Q8BGU0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cyp4f39Q8BGU0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cyp4f39Q8BGU0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cyp4f39Q8BGU0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyp4f39Q8BGU0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyp4f39Q8BGU0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyp4f39Q8BGU0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyp4f39Q8BGU0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyp4f39Q8BGU0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp4f39Q8BGU0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp4f39Q8BGU0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp4f39Q8BGU0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp4f39Q8BGU0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp4f39Q8BGU0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp4f39Q8BGU0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp4f39Q8BGU0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp4f39Q8BGU0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp4f39Q8BGU0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp4f39Q8BGU0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp4f39Q8BGU0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp4f39Q8BGU0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp4f39Q8BGU0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp4f39Q8BGU0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms