Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc50Q810U5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc50Q810U5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc50Q810U5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc50Q810U5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc50Q810U5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc50Q810U5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc50Q810U5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc50Q810U5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc50Q810U5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc50Q810U5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc50Q810U5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc50Q810U5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc50Q810U5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc50Q810U5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc50Q810U5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc50Q810U5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc50Q810U5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc50Q810U5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc50Q810U5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc50Q810U5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc50Q810U5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc50Q810U5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc50Q810U5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc50Q810U5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc50Q810U5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc50Q810U5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc50Q810U5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc50Q810U5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc50Q810U5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc50Q810U5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc50Q810U5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc50Q810U5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc50Q810U5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc50Q810U5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc50Q810U5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc50Q810U5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc50Q810U5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc50Q810U5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc50Q810U5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc50Q810U5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc50Q810U5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc50Q810U5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc50Q810U5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc50Q810U5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc50Q810U5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc50Q810U5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc50Q810U5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc50Q810U5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc50Q810U5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc50Q810U5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc50Q810U5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc50Q810U5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc50Q810U5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc50Q810U5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc50Q810U5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc50Q810U5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc50Q810U5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc50Q810U5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc50Q810U5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc50Q810U5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc50Q810U5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc50Q810U5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc50Q810U5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc50Q810U5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Ccdc50Q810U5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc50Q810U5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc50Q810U5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc50Q810U5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc50Q810U5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc50Q810U5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc50Q810U5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc50Q810U5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc50Q810U5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc50Q810U5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc50Q810U5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc50Q810U5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc50Q810U5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc50Q810U5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc50Q810U5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc50Q810U5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc50Q810U5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc50Q810U5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc50Q810U5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc50Q810U5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc50Q810U5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc50Q810U5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc50Q810U5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc50Q810U5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc50Q810U5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc50Q810U5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc50Q810U5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc50Q810U5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc50Q810U5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc50Q810U5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc50Q810U5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc50Q810U5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc50Q810U5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc50Q810U5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc50Q810U5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms