Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Clec18aQ7TSQ1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Clec18aQ7TSQ1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Clec18aQ7TSQ1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Clec18aQ7TSQ1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Clec18aQ7TSQ1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Clec18aQ7TSQ1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Clec18aQ7TSQ1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Clec18aQ7TSQ1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Clec18aQ7TSQ1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clec18aQ7TSQ1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clec18aQ7TSQ1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clec18aQ7TSQ1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Clec18aQ7TSQ1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clec18aQ7TSQ1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clec18aQ7TSQ1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clec18aQ7TSQ1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clec18aQ7TSQ1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clec18aQ7TSQ1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clec18aQ7TSQ1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Clec18aQ7TSQ1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Clec18aQ7TSQ1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Clec18aQ7TSQ1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Clec18aQ7TSQ1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Clec18aQ7TSQ1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clec18aQ7TSQ1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clec18aQ7TSQ1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clec18aQ7TSQ1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clec18aQ7TSQ1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clec18aQ7TSQ1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clec18aQ7TSQ1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Clec18aQ7TSQ1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Clec18aQ7TSQ1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Clec18aQ7TSQ1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Clec18aQ7TSQ1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Clec18aQ7TSQ1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clec18aQ7TSQ1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Clec18aQ7TSQ1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clec18aQ7TSQ1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clec18aQ7TSQ1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clec18aQ7TSQ1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Clec18aQ7TSQ1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Clec18aQ7TSQ1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Clec18aQ7TSQ1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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