Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQK5

Ccdc93, Coiled-coil domain-containing protein 93, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc93Q7TQK5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc93Q7TQK5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc93Q7TQK5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc93Q7TQK5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc93Q7TQK5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc93Q7TQK5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc93Q7TQK5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc93Q7TQK5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc93Q7TQK5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc93Q7TQK5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc93Q7TQK5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc93Q7TQK5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc93Q7TQK5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc93Q7TQK5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc93Q7TQK5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc93Q7TQK5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc93Q7TQK5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc93Q7TQK5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc93Q7TQK5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc93Q7TQK5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc93Q7TQK5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc93Q7TQK5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc93Q7TQK5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc93Q7TQK5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc93Q7TQK5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc93Q7TQK5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc93Q7TQK5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc93Q7TQK5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc93Q7TQK5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc93Q7TQK5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc93Q7TQK5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc93Q7TQK5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc93Q7TQK5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc93Q7TQK5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc93Q7TQK5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc93Q7TQK5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc93Q7TQK5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc93Q7TQK5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc93Q7TQK5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc93Q7TQK5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc93Q7TQK5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc93Q7TQK5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc93Q7TQK5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc93Q7TQK5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc93Q7TQK5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc93Q7TQK5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc93Q7TQK5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc93Q7TQK5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc93Q7TQK5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc93Q7TQK5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc93Q7TQK5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc93Q7TQK5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc93Q7TQK5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc93Q7TQK5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc93Q7TQK5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc93Q7TQK5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc93Q7TQK5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc93Q7TQK5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc93Q7TQK5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc93Q7TQK5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc93Q7TQK5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc93Q7TQK5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc93Q7TQK5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc93Q7TQK5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc93Q7TQK5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc93Q7TQK5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc93Q7TQK5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc93Q7TQK5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc93Q7TQK5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc93Q7TQK5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc93Q7TQK5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc93Q7TQK5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc93Q7TQK5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc93Q7TQK5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc93Q7TQK5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc93Q7TQK5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc93Q7TQK5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc93Q7TQK5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc93Q7TQK5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc93Q7TQK5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc93Q7TQK5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc93Q7TQK5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc93Q7TQK5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc93Q7TQK5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc93Q7TQK5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc93Q7TQK5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc93Q7TQK5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc93Q7TQK5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc93Q7TQK5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc93Q7TQK5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc93Q7TQK5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc93Q7TQK5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc93Q7TQK5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc93Q7TQK5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc93Q7TQK5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc93Q7TQK5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc93Q7TQK5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc93Q7TQK5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc93Q7TQK5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc93Q7TQK5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms