Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim17Q7TPM3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim17Q7TPM3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim17Q7TPM3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim17Q7TPM3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim17Q7TPM3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim17Q7TPM3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim17Q7TPM3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim17Q7TPM3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim17Q7TPM3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim17Q7TPM3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim17Q7TPM3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim17Q7TPM3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim17Q7TPM3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim17Q7TPM3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim17Q7TPM3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim17Q7TPM3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim17Q7TPM3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim17Q7TPM3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim17Q7TPM3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim17Q7TPM3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim17Q7TPM3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim17Q7TPM3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim17Q7TPM3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim17Q7TPM3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim17Q7TPM3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim17Q7TPM3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim17Q7TPM3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim17Q7TPM3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim17Q7TPM3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim17Q7TPM3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim17Q7TPM3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim17Q7TPM3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim17Q7TPM3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim17Q7TPM3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim17Q7TPM3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim17Q7TPM3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim17Q7TPM3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim17Q7TPM3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim17Q7TPM3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim17Q7TPM3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim17Q7TPM3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim17Q7TPM3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim17Q7TPM3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim17Q7TPM3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim17Q7TPM3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim17Q7TPM3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim17Q7TPM3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim17Q7TPM3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim17Q7TPM3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim17Q7TPM3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim17Q7TPM3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim17Q7TPM3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim17Q7TPM3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim17Q7TPM3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim17Q7TPM3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim17Q7TPM3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim17Q7TPM3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim17Q7TPM3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim17Q7TPM3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim17Q7TPM3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim17Q7TPM3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim17Q7TPM3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim17Q7TPM3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim17Q7TPM3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim17Q7TPM3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim17Q7TPM3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim17Q7TPM3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim17Q7TPM3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim17Q7TPM3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim17Q7TPM3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim17Q7TPM3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim17Q7TPM3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim17Q7TPM3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim17Q7TPM3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim17Q7TPM3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim17Q7TPM3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim17Q7TPM3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim17Q7TPM3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim17Q7TPM3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim17Q7TPM3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim17Q7TPM3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim17Q7TPM3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim17Q7TPM3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim17Q7TPM3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim17Q7TPM3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trim17Q7TPM3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim17Q7TPM3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim17Q7TPM3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim17Q7TPM3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim17Q7TPM3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim17Q7TPM3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim17Q7TPM3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim17Q7TPM3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim17Q7TPM3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim17Q7TPM3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim17Q7TPM3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim17Q7TPM3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim17Q7TPM3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim17Q7TPM3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms