Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMK9

Syncrip, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncripQ7TMK9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SyncripQ7TMK9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SyncripQ7TMK9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SyncripQ7TMK9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SyncripQ7TMK9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SyncripQ7TMK9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SyncripQ7TMK9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SyncripQ7TMK9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SyncripQ7TMK9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SyncripQ7TMK9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SyncripQ7TMK9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SyncripQ7TMK9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SyncripQ7TMK9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SyncripQ7TMK9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SyncripQ7TMK9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SyncripQ7TMK9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SyncripQ7TMK9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SyncripQ7TMK9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SyncripQ7TMK9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SyncripQ7TMK9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SyncripQ7TMK9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SyncripQ7TMK9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SyncripQ7TMK9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SyncripQ7TMK9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SyncripQ7TMK9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SyncripQ7TMK9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SyncripQ7TMK9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SyncripQ7TMK9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SyncripQ7TMK9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SyncripQ7TMK9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SyncripQ7TMK9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SyncripQ7TMK9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SyncripQ7TMK9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SyncripQ7TMK9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SyncripQ7TMK9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SyncripQ7TMK9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SyncripQ7TMK9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SyncripQ7TMK9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SyncripQ7TMK9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SyncripQ7TMK9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SyncripQ7TMK9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SyncripQ7TMK9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SyncripQ7TMK9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SyncripQ7TMK9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SyncripQ7TMK9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SyncripQ7TMK9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SyncripQ7TMK9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SyncripQ7TMK9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SyncripQ7TMK9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SyncripQ7TMK9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SyncripQ7TMK9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SyncripQ7TMK9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SyncripQ7TMK9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SyncripQ7TMK9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SyncripQ7TMK9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SyncripQ7TMK9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SyncripQ7TMK9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SyncripQ7TMK9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SyncripQ7TMK9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SyncripQ7TMK9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SyncripQ7TMK9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SyncripQ7TMK9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SyncripQ7TMK9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SyncripQ7TMK9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SyncripQ7TMK9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SyncripQ7TMK9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SyncripQ7TMK9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SyncripQ7TMK9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SyncripQ7TMK9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SyncripQ7TMK9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SyncripQ7TMK9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SyncripQ7TMK9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SyncripQ7TMK9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SyncripQ7TMK9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SyncripQ7TMK9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SyncripQ7TMK9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SyncripQ7TMK9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SyncripQ7TMK9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SyncripQ7TMK9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SyncripQ7TMK9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SyncripQ7TMK9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SyncripQ7TMK9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SyncripQ7TMK9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SyncripQ7TMK9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SyncripQ7TMK9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SyncripQ7TMK9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SyncripQ7TMK9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SyncripQ7TMK9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SyncripQ7TMK9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SyncripQ7TMK9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SyncripQ7TMK9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SyncripQ7TMK9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SyncripQ7TMK9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SyncripQ7TMK9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SyncripQ7TMK9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SyncripQ7TMK9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SyncripQ7TMK9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SyncripQ7TMK9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SyncripQ7TMK9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SyncripQ7TMK9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms