Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TwistnbQ78WZ7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TwistnbQ78WZ7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TwistnbQ78WZ7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TwistnbQ78WZ7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TwistnbQ78WZ7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TwistnbQ78WZ7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TwistnbQ78WZ7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TwistnbQ78WZ7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TwistnbQ78WZ7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TwistnbQ78WZ7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TwistnbQ78WZ7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TwistnbQ78WZ7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TwistnbQ78WZ7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TwistnbQ78WZ7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TwistnbQ78WZ7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TwistnbQ78WZ7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TwistnbQ78WZ7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TwistnbQ78WZ7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TwistnbQ78WZ7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TwistnbQ78WZ7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TwistnbQ78WZ7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TwistnbQ78WZ7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TwistnbQ78WZ7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TwistnbQ78WZ7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TwistnbQ78WZ7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TwistnbQ78WZ7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TwistnbQ78WZ7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TwistnbQ78WZ7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TwistnbQ78WZ7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TwistnbQ78WZ7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TwistnbQ78WZ7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TwistnbQ78WZ7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TwistnbQ78WZ7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TwistnbQ78WZ7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TwistnbQ78WZ7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TwistnbQ78WZ7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TwistnbQ78WZ7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TwistnbQ78WZ7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TwistnbQ78WZ7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TwistnbQ78WZ7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TwistnbQ78WZ7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TwistnbQ78WZ7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TwistnbQ78WZ7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TwistnbQ78WZ7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TwistnbQ78WZ7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TwistnbQ78WZ7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms