Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snd1Q78PY7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snd1Q78PY7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snd1Q78PY7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snd1Q78PY7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snd1Q78PY7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snd1Q78PY7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snd1Q78PY7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Snd1Q78PY7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snd1Q78PY7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Snd1Q78PY7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snd1Q78PY7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snd1Q78PY7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snd1Q78PY7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snd1Q78PY7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snd1Q78PY7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snd1Q78PY7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snd1Q78PY7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snd1Q78PY7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snd1Q78PY7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snd1Q78PY7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snd1Q78PY7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snd1Q78PY7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snd1Q78PY7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snd1Q78PY7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snd1Q78PY7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snd1Q78PY7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snd1Q78PY7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snd1Q78PY7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snd1Q78PY7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snd1Q78PY7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snd1Q78PY7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snd1Q78PY7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snd1Q78PY7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snd1Q78PY7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snd1Q78PY7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snd1Q78PY7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snd1Q78PY7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snd1Q78PY7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snd1Q78PY7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snd1Q78PY7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snd1Q78PY7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Snd1Q78PY7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snd1Q78PY7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snd1Q78PY7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snd1Q78PY7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snd1Q78PY7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snd1Q78PY7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snd1Q78PY7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snd1Q78PY7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snd1Q78PY7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snd1Q78PY7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snd1Q78PY7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snd1Q78PY7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snd1Q78PY7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snd1Q78PY7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snd1Q78PY7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snd1Q78PY7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snd1Q78PY7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snd1Q78PY7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snd1Q78PY7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snd1Q78PY7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Snd1Q78PY7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snd1Q78PY7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snd1Q78PY7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snd1Q78PY7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snd1Q78PY7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snd1Q78PY7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snd1Q78PY7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snd1Q78PY7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snd1Q78PY7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snd1Q78PY7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snd1Q78PY7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snd1Q78PY7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snd1Q78PY7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snd1Q78PY7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Snd1Q78PY7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snd1Q78PY7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snd1Q78PY7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snd1Q78PY7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snd1Q78PY7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snd1Q78PY7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snd1Q78PY7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snd1Q78PY7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Snd1Q78PY7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snd1Q78PY7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snd1Q78PY7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snd1Q78PY7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snd1Q78PY7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snd1Q78PY7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snd1Q78PY7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snd1Q78PY7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snd1Q78PY7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snd1Q78PY7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snd1Q78PY7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snd1Q78PY7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snd1Q78PY7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snd1Q78PY7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snd1Q78PY7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snd1Q78PY7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms