Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cd3eapQ76KJ5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cd3eapQ76KJ5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cd3eapQ76KJ5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cd3eapQ76KJ5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cd3eapQ76KJ5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cd3eapQ76KJ5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cd3eapQ76KJ5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cd3eapQ76KJ5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cd3eapQ76KJ5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cd3eapQ76KJ5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cd3eapQ76KJ5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cd3eapQ76KJ5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cd3eapQ76KJ5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cd3eapQ76KJ5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cd3eapQ76KJ5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Cd3eapQ76KJ5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cd3eapQ76KJ5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cd3eapQ76KJ5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cd3eapQ76KJ5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cd3eapQ76KJ5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cd3eapQ76KJ5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cd3eapQ76KJ5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Cd3eapQ76KJ5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cd3eapQ76KJ5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cd3eapQ76KJ5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cd3eapQ76KJ5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cd3eapQ76KJ5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cd3eapQ76KJ5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cd3eapQ76KJ5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cd3eapQ76KJ5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cd3eapQ76KJ5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cd3eapQ76KJ5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cd3eapQ76KJ5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cd3eapQ76KJ5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cd3eapQ76KJ5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Cd3eapQ76KJ5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cd3eapQ76KJ5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cd3eapQ76KJ5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cd3eapQ76KJ5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cd3eapQ76KJ5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cd3eapQ76KJ5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cd3eapQ76KJ5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cd3eapQ76KJ5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cd3eapQ76KJ5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cd3eapQ76KJ5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cd3eapQ76KJ5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Cd3eapQ76KJ5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cd3eapQ76KJ5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Cd3eapQ76KJ5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cd3eapQ76KJ5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cd3eapQ76KJ5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cd3eapQ76KJ5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cd3eapQ76KJ5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cd3eapQ76KJ5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cd3eapQ76KJ5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cd3eapQ76KJ5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cd3eapQ76KJ5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cd3eapQ76KJ5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cd3eapQ76KJ5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Cd3eapQ76KJ5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cd3eapQ76KJ5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cd3eapQ76KJ5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cd3eapQ76KJ5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cd3eapQ76KJ5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cd3eapQ76KJ5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cd3eapQ76KJ5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cd3eapQ76KJ5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cd3eapQ76KJ5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cd3eapQ76KJ5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cd3eapQ76KJ5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cd3eapQ76KJ5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cd3eapQ76KJ5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cd3eapQ76KJ5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cd3eapQ76KJ5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cd3eapQ76KJ5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cd3eapQ76KJ5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cd3eapQ76KJ5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cd3eapQ76KJ5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cd3eapQ76KJ5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cd3eapQ76KJ5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cd3eapQ76KJ5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cd3eapQ76KJ5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cd3eapQ76KJ5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cd3eapQ76KJ5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cd3eapQ76KJ5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cd3eapQ76KJ5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cd3eapQ76KJ5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cd3eapQ76KJ5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cd3eapQ76KJ5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cd3eapQ76KJ5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cd3eapQ76KJ5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cd3eapQ76KJ5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cd3eapQ76KJ5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cd3eapQ76KJ5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cd3eapQ76KJ5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cd3eapQ76KJ5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cd3eapQ76KJ5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cd3eapQ76KJ5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cd3eapQ76KJ5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms