Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc88cQ6VGS5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc88cQ6VGS5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc88cQ6VGS5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc88cQ6VGS5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc88cQ6VGS5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc88cQ6VGS5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc88cQ6VGS5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc88cQ6VGS5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc88cQ6VGS5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc88cQ6VGS5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc88cQ6VGS5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms