Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2P8

Neil2, Endonuclease 8-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil2Q6R2P8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1056.8 ms