Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGE4

Znf316, Zinc finger protein 316, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf316Q6PGE4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Znf316Q6PGE4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Znf316Q6PGE4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Znf316Q6PGE4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Znf316Q6PGE4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Znf316Q6PGE4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Znf316Q6PGE4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Znf316Q6PGE4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Znf316Q6PGE4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Znf316Q6PGE4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Znf316Q6PGE4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Znf316Q6PGE4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Znf316Q6PGE4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Znf316Q6PGE4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Znf316Q6PGE4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Znf316Q6PGE4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Znf316Q6PGE4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Znf316Q6PGE4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Znf316Q6PGE4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Znf316Q6PGE4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Znf316Q6PGE4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Znf316Q6PGE4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Znf316Q6PGE4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Znf316Q6PGE4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Znf316Q6PGE4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Znf316Q6PGE4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Znf316Q6PGE4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Znf316Q6PGE4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Znf316Q6PGE4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Znf316Q6PGE4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Znf316Q6PGE4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Znf316Q6PGE4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Znf316Q6PGE4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Znf316Q6PGE4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Znf316Q6PGE4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Znf316Q6PGE4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Znf316Q6PGE4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Znf316Q6PGE4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Znf316Q6PGE4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Znf316Q6PGE4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Znf316Q6PGE4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Znf316Q6PGE4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Znf316Q6PGE4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Znf316Q6PGE4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Znf316Q6PGE4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Znf316Q6PGE4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Znf316Q6PGE4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Znf316Q6PGE4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Znf316Q6PGE4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Znf316Q6PGE4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Znf316Q6PGE4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Znf316Q6PGE4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Znf316Q6PGE4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Znf316Q6PGE4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Znf316Q6PGE4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Znf316Q6PGE4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Znf316Q6PGE4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Znf316Q6PGE4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Znf316Q6PGE4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Znf316Q6PGE4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Znf316Q6PGE4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Znf316Q6PGE4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Znf316Q6PGE4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Znf316Q6PGE4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Znf316Q6PGE4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Znf316Q6PGE4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Znf316Q6PGE4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Znf316Q6PGE4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Znf316Q6PGE4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Znf316Q6PGE4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Znf316Q6PGE4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Znf316Q6PGE4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Znf316Q6PGE4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Znf316Q6PGE4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Znf316Q6PGE4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Znf316Q6PGE4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Znf316Q6PGE4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Znf316Q6PGE4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Znf316Q6PGE4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Znf316Q6PGE4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Znf316Q6PGE4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Znf316Q6PGE4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Znf316Q6PGE4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Znf316Q6PGE4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Znf316Q6PGE4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Znf316Q6PGE4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Znf316Q6PGE4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Znf316Q6PGE4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Znf316Q6PGE4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Znf316Q6PGE4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Znf316Q6PGE4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Znf316Q6PGE4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Znf316Q6PGE4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Znf316Q6PGE4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Znf316Q6PGE4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Znf316Q6PGE4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Znf316Q6PGE4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Znf316Q6PGE4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Znf316Q6PGE4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Znf316Q6PGE4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms