Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc82Q6PG04 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc82Q6PG04 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc82Q6PG04 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc82Q6PG04 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc82Q6PG04 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc82Q6PG04 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc82Q6PG04 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc82Q6PG04 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc82Q6PG04 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc82Q6PG04 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc82Q6PG04 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc82Q6PG04 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc82Q6PG04 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc82Q6PG04 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc82Q6PG04 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc82Q6PG04 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc82Q6PG04 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc82Q6PG04 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc82Q6PG04 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc82Q6PG04 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc82Q6PG04 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc82Q6PG04 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc82Q6PG04 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc82Q6PG04 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc82Q6PG04 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc82Q6PG04 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc82Q6PG04 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc82Q6PG04 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc82Q6PG04 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc82Q6PG04 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc82Q6PG04 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc82Q6PG04 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc82Q6PG04 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc82Q6PG04 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc82Q6PG04 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc82Q6PG04 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc82Q6PG04 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc82Q6PG04 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc82Q6PG04 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc82Q6PG04 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc82Q6PG04 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc82Q6PG04 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc82Q6PG04 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc82Q6PG04 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc82Q6PG04 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc82Q6PG04 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc82Q6PG04 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc82Q6PG04 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc82Q6PG04 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc82Q6PG04 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc82Q6PG04 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc82Q6PG04 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc82Q6PG04 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc82Q6PG04 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc82Q6PG04 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc82Q6PG04 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc82Q6PG04 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc82Q6PG04 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc82Q6PG04 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc82Q6PG04 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc82Q6PG04 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc82Q6PG04 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc82Q6PG04 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc82Q6PG04 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc82Q6PG04 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc82Q6PG04 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc82Q6PG04 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc82Q6PG04 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc82Q6PG04 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc82Q6PG04 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc82Q6PG04 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc82Q6PG04 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc82Q6PG04 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc82Q6PG04 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc82Q6PG04 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc82Q6PG04 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc82Q6PG04 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc82Q6PG04 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc82Q6PG04 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc82Q6PG04 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc82Q6PG04 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc82Q6PG04 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc82Q6PG04 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc82Q6PG04 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc82Q6PG04 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc82Q6PG04 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc82Q6PG04 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc82Q6PG04 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc82Q6PG04 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc82Q6PG04 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc82Q6PG04 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc82Q6PG04 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc82Q6PG04 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc82Q6PG04 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc82Q6PG04 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc82Q6PG04 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc82Q6PG04 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc82Q6PG04 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc82Q6PG04 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms