Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE13

Prrt3, Proline-rich transmembrane protein 3, mousemouse

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Length 971 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt3Q6PE13 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prrt3Q6PE13 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prrt3Q6PE13 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prrt3Q6PE13 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prrt3Q6PE13 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prrt3Q6PE13 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prrt3Q6PE13 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prrt3Q6PE13 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prrt3Q6PE13 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prrt3Q6PE13 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prrt3Q6PE13 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prrt3Q6PE13 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prrt3Q6PE13 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prrt3Q6PE13 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prrt3Q6PE13 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prrt3Q6PE13 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prrt3Q6PE13 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prrt3Q6PE13 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prrt3Q6PE13 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prrt3Q6PE13 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Prrt3Q6PE13 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prrt3Q6PE13 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prrt3Q6PE13 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prrt3Q6PE13 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prrt3Q6PE13 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prrt3Q6PE13 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Prrt3Q6PE13 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prrt3Q6PE13 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prrt3Q6PE13 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prrt3Q6PE13 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prrt3Q6PE13 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prrt3Q6PE13 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prrt3Q6PE13 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prrt3Q6PE13 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prrt3Q6PE13 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prrt3Q6PE13 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prrt3Q6PE13 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prrt3Q6PE13 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prrt3Q6PE13 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prrt3Q6PE13 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prrt3Q6PE13 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prrt3Q6PE13 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Prrt3Q6PE13 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prrt3Q6PE13 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prrt3Q6PE13 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prrt3Q6PE13 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prrt3Q6PE13 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prrt3Q6PE13 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prrt3Q6PE13 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prrt3Q6PE13 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prrt3Q6PE13 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prrt3Q6PE13 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prrt3Q6PE13 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prrt3Q6PE13 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prrt3Q6PE13 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prrt3Q6PE13 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prrt3Q6PE13 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prrt3Q6PE13 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prrt3Q6PE13 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prrt3Q6PE13 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prrt3Q6PE13 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prrt3Q6PE13 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prrt3Q6PE13 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prrt3Q6PE13 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prrt3Q6PE13 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prrt3Q6PE13 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prrt3Q6PE13 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prrt3Q6PE13 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prrt3Q6PE13 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prrt3Q6PE13 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Prrt3Q6PE13 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prrt3Q6PE13 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prrt3Q6PE13 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prrt3Q6PE13 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prrt3Q6PE13 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prrt3Q6PE13 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prrt3Q6PE13 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prrt3Q6PE13 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prrt3Q6PE13 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prrt3Q6PE13 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prrt3Q6PE13 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prrt3Q6PE13 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prrt3Q6PE13 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prrt3Q6PE13 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prrt3Q6PE13 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prrt3Q6PE13 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prrt3Q6PE13 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prrt3Q6PE13 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prrt3Q6PE13 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prrt3Q6PE13 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prrt3Q6PE13 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prrt3Q6PE13 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prrt3Q6PE13 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Prrt3Q6PE13 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prrt3Q6PE13 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prrt3Q6PE13 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prrt3Q6PE13 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prrt3Q6PE13 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prrt3Q6PE13 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prrt3Q6PE13 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms