Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S1

Atmin, ATM interactor, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtminQ6P9S1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AtminQ6P9S1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AtminQ6P9S1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AtminQ6P9S1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AtminQ6P9S1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AtminQ6P9S1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AtminQ6P9S1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AtminQ6P9S1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AtminQ6P9S1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AtminQ6P9S1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
AtminQ6P9S1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AtminQ6P9S1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AtminQ6P9S1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AtminQ6P9S1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AtminQ6P9S1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AtminQ6P9S1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AtminQ6P9S1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AtminQ6P9S1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AtminQ6P9S1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AtminQ6P9S1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
AtminQ6P9S1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AtminQ6P9S1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AtminQ6P9S1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AtminQ6P9S1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AtminQ6P9S1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
AtminQ6P9S1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AtminQ6P9S1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AtminQ6P9S1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AtminQ6P9S1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AtminQ6P9S1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AtminQ6P9S1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AtminQ6P9S1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AtminQ6P9S1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AtminQ6P9S1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AtminQ6P9S1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AtminQ6P9S1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AtminQ6P9S1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AtminQ6P9S1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AtminQ6P9S1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AtminQ6P9S1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AtminQ6P9S1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AtminQ6P9S1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AtminQ6P9S1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AtminQ6P9S1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AtminQ6P9S1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AtminQ6P9S1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AtminQ6P9S1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AtminQ6P9S1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AtminQ6P9S1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
AtminQ6P9S1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AtminQ6P9S1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AtminQ6P9S1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AtminQ6P9S1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AtminQ6P9S1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AtminQ6P9S1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AtminQ6P9S1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AtminQ6P9S1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AtminQ6P9S1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AtminQ6P9S1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AtminQ6P9S1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AtminQ6P9S1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AtminQ6P9S1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AtminQ6P9S1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AtminQ6P9S1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AtminQ6P9S1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AtminQ6P9S1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
AtminQ6P9S1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AtminQ6P9S1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AtminQ6P9S1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AtminQ6P9S1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AtminQ6P9S1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
AtminQ6P9S1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
AtminQ6P9S1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AtminQ6P9S1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
AtminQ6P9S1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AtminQ6P9S1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AtminQ6P9S1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AtminQ6P9S1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AtminQ6P9S1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AtminQ6P9S1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AtminQ6P9S1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
AtminQ6P9S1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AtminQ6P9S1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AtminQ6P9S1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
AtminQ6P9S1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AtminQ6P9S1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AtminQ6P9S1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AtminQ6P9S1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AtminQ6P9S1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AtminQ6P9S1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AtminQ6P9S1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AtminQ6P9S1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AtminQ6P9S1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AtminQ6P9S1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AtminQ6P9S1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AtminQ6P9S1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AtminQ6P9S1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AtminQ6P9S1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AtminQ6P9S1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AtminQ6P9S1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms