Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T1

Snx19, Sorting nexin-19, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx19Q6P4T1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx19Q6P4T1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx19Q6P4T1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx19Q6P4T1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx19Q6P4T1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx19Q6P4T1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx19Q6P4T1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx19Q6P4T1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx19Q6P4T1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx19Q6P4T1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx19Q6P4T1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx19Q6P4T1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx19Q6P4T1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx19Q6P4T1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx19Q6P4T1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx19Q6P4T1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx19Q6P4T1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx19Q6P4T1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx19Q6P4T1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx19Q6P4T1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx19Q6P4T1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx19Q6P4T1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx19Q6P4T1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx19Q6P4T1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx19Q6P4T1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx19Q6P4T1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx19Q6P4T1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx19Q6P4T1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx19Q6P4T1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx19Q6P4T1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx19Q6P4T1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx19Q6P4T1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx19Q6P4T1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx19Q6P4T1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx19Q6P4T1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx19Q6P4T1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx19Q6P4T1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx19Q6P4T1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx19Q6P4T1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx19Q6P4T1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx19Q6P4T1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx19Q6P4T1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx19Q6P4T1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx19Q6P4T1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx19Q6P4T1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx19Q6P4T1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx19Q6P4T1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx19Q6P4T1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx19Q6P4T1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx19Q6P4T1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx19Q6P4T1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx19Q6P4T1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx19Q6P4T1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx19Q6P4T1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx19Q6P4T1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx19Q6P4T1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx19Q6P4T1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx19Q6P4T1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx19Q6P4T1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms