Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Wdr44Q6NVE8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Wdr44Q6NVE8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Wdr44Q6NVE8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Wdr44Q6NVE8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Wdr44Q6NVE8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Wdr44Q6NVE8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Wdr44Q6NVE8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Wdr44Q6NVE8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Wdr44Q6NVE8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Wdr44Q6NVE8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Wdr44Q6NVE8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Wdr44Q6NVE8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Wdr44Q6NVE8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Wdr44Q6NVE8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Wdr44Q6NVE8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Wdr44Q6NVE8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Wdr44Q6NVE8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Wdr44Q6NVE8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Wdr44Q6NVE8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Wdr44Q6NVE8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Wdr44Q6NVE8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Wdr44Q6NVE8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Wdr44Q6NVE8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Wdr44Q6NVE8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Wdr44Q6NVE8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Wdr44Q6NVE8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Wdr44Q6NVE8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Wdr44Q6NVE8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Wdr44Q6NVE8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Wdr44Q6NVE8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Wdr44Q6NVE8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Wdr44Q6NVE8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Wdr44Q6NVE8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Wdr44Q6NVE8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Wdr44Q6NVE8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Wdr44Q6NVE8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Wdr44Q6NVE8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Wdr44Q6NVE8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Wdr44Q6NVE8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Wdr44Q6NVE8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Wdr44Q6NVE8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Wdr44Q6NVE8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Wdr44Q6NVE8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Wdr44Q6NVE8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Wdr44Q6NVE8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Wdr44Q6NVE8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Wdr44Q6NVE8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Wdr44Q6NVE8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Wdr44Q6NVE8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Wdr44Q6NVE8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Wdr44Q6NVE8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Wdr44Q6NVE8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Wdr44Q6NVE8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Wdr44Q6NVE8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Wdr44Q6NVE8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Wdr44Q6NVE8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Wdr44Q6NVE8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Wdr44Q6NVE8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Wdr44Q6NVE8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Wdr44Q6NVE8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Wdr44Q6NVE8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Wdr44Q6NVE8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Wdr44Q6NVE8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Wdr44Q6NVE8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Wdr44Q6NVE8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Wdr44Q6NVE8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Wdr44Q6NVE8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Wdr44Q6NVE8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Wdr44Q6NVE8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Wdr44Q6NVE8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Wdr44Q6NVE8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Wdr44Q6NVE8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Wdr44Q6NVE8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Wdr44Q6NVE8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Wdr44Q6NVE8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Wdr44Q6NVE8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Wdr44Q6NVE8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Wdr44Q6NVE8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Wdr44Q6NVE8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Wdr44Q6NVE8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Wdr44Q6NVE8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Wdr44Q6NVE8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Wdr44Q6NVE8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Wdr44Q6NVE8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Wdr44Q6NVE8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Wdr44Q6NVE8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Wdr44Q6NVE8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Wdr44Q6NVE8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Wdr44Q6NVE8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Wdr44Q6NVE8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Wdr44Q6NVE8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Wdr44Q6NVE8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Wdr44Q6NVE8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Wdr44Q6NVE8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Wdr44Q6NVE8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Wdr44Q6NVE8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Wdr44Q6NVE8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Wdr44Q6NVE8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Wdr44Q6NVE8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms