Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS82

Retreg2, Reticulophagy regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Retreg2Q6NS82 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retreg2Q6NS82 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retreg2Q6NS82 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retreg2Q6NS82 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retreg2Q6NS82 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retreg2Q6NS82 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retreg2Q6NS82 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retreg2Q6NS82 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retreg2Q6NS82 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retreg2Q6NS82 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Retreg2Q6NS82 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retreg2Q6NS82 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retreg2Q6NS82 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retreg2Q6NS82 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Retreg2Q6NS82 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retreg2Q6NS82 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retreg2Q6NS82 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retreg2Q6NS82 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retreg2Q6NS82 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retreg2Q6NS82 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retreg2Q6NS82 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retreg2Q6NS82 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retreg2Q6NS82 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retreg2Q6NS82 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Retreg2Q6NS82 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retreg2Q6NS82 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retreg2Q6NS82 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retreg2Q6NS82 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retreg2Q6NS82 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retreg2Q6NS82 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retreg2Q6NS82 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retreg2Q6NS82 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retreg2Q6NS82 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retreg2Q6NS82 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retreg2Q6NS82 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retreg2Q6NS82 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retreg2Q6NS82 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retreg2Q6NS82 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retreg2Q6NS82 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retreg2Q6NS82 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retreg2Q6NS82 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retreg2Q6NS82 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retreg2Q6NS82 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retreg2Q6NS82 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retreg2Q6NS82 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retreg2Q6NS82 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retreg2Q6NS82 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retreg2Q6NS82 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retreg2Q6NS82 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retreg2Q6NS82 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retreg2Q6NS82 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retreg2Q6NS82 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retreg2Q6NS82 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Retreg2Q6NS82 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retreg2Q6NS82 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retreg2Q6NS82 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retreg2Q6NS82 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retreg2Q6NS82 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retreg2Q6NS82 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retreg2Q6NS82 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retreg2Q6NS82 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retreg2Q6NS82 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retreg2Q6NS82 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retreg2Q6NS82 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retreg2Q6NS82 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retreg2Q6NS82 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retreg2Q6NS82 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retreg2Q6NS82 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retreg2Q6NS82 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retreg2Q6NS82 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retreg2Q6NS82 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retreg2Q6NS82 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retreg2Q6NS82 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retreg2Q6NS82 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retreg2Q6NS82 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retreg2Q6NS82 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retreg2Q6NS82 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retreg2Q6NS82 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retreg2Q6NS82 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retreg2Q6NS82 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retreg2Q6NS82 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retreg2Q6NS82 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retreg2Q6NS82 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retreg2Q6NS82 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retreg2Q6NS82 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retreg2Q6NS82 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retreg2Q6NS82 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retreg2Q6NS82 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retreg2Q6NS82 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retreg2Q6NS82 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retreg2Q6NS82 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retreg2Q6NS82 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retreg2Q6NS82 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retreg2Q6NS82 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retreg2Q6NS82 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retreg2Q6NS82 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retreg2Q6NS82 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retreg2Q6NS82 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retreg2Q6NS82 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retreg2Q6NS82 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.8 ms