Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg16l2Q6KAU8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg16l2Q6KAU8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg16l2Q6KAU8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg16l2Q6KAU8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg16l2Q6KAU8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg16l2Q6KAU8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg16l2Q6KAU8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg16l2Q6KAU8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg16l2Q6KAU8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg16l2Q6KAU8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg16l2Q6KAU8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg16l2Q6KAU8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg16l2Q6KAU8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg16l2Q6KAU8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg16l2Q6KAU8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg16l2Q6KAU8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg16l2Q6KAU8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg16l2Q6KAU8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg16l2Q6KAU8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg16l2Q6KAU8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg16l2Q6KAU8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg16l2Q6KAU8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg16l2Q6KAU8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg16l2Q6KAU8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg16l2Q6KAU8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg16l2Q6KAU8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg16l2Q6KAU8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg16l2Q6KAU8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg16l2Q6KAU8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg16l2Q6KAU8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg16l2Q6KAU8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg16l2Q6KAU8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg16l2Q6KAU8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg16l2Q6KAU8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg16l2Q6KAU8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg16l2Q6KAU8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg16l2Q6KAU8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg16l2Q6KAU8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg16l2Q6KAU8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg16l2Q6KAU8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg16l2Q6KAU8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg16l2Q6KAU8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg16l2Q6KAU8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg16l2Q6KAU8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg16l2Q6KAU8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg16l2Q6KAU8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg16l2Q6KAU8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg16l2Q6KAU8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg16l2Q6KAU8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg16l2Q6KAU8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg16l2Q6KAU8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg16l2Q6KAU8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg16l2Q6KAU8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg16l2Q6KAU8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg16l2Q6KAU8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg16l2Q6KAU8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg16l2Q6KAU8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg16l2Q6KAU8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg16l2Q6KAU8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg16l2Q6KAU8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg16l2Q6KAU8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg16l2Q6KAU8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg16l2Q6KAU8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg16l2Q6KAU8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg16l2Q6KAU8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg16l2Q6KAU8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg16l2Q6KAU8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg16l2Q6KAU8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg16l2Q6KAU8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg16l2Q6KAU8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg16l2Q6KAU8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg16l2Q6KAU8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg16l2Q6KAU8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg16l2Q6KAU8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg16l2Q6KAU8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg16l2Q6KAU8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg16l2Q6KAU8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg16l2Q6KAU8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg16l2Q6KAU8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg16l2Q6KAU8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg16l2Q6KAU8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg16l2Q6KAU8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg16l2Q6KAU8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg16l2Q6KAU8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg16l2Q6KAU8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg16l2Q6KAU8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atg16l2Q6KAU8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atg16l2Q6KAU8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atg16l2Q6KAU8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg16l2Q6KAU8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg16l2Q6KAU8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg16l2Q6KAU8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg16l2Q6KAU8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg16l2Q6KAU8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg16l2Q6KAU8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg16l2Q6KAU8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg16l2Q6KAU8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg16l2Q6KAU8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg16l2Q6KAU8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms