Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scaf8Q6DID3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scaf8Q6DID3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scaf8Q6DID3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scaf8Q6DID3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scaf8Q6DID3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scaf8Q6DID3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scaf8Q6DID3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scaf8Q6DID3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scaf8Q6DID3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Scaf8Q6DID3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scaf8Q6DID3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scaf8Q6DID3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scaf8Q6DID3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scaf8Q6DID3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scaf8Q6DID3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scaf8Q6DID3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scaf8Q6DID3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scaf8Q6DID3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scaf8Q6DID3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scaf8Q6DID3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scaf8Q6DID3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scaf8Q6DID3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scaf8Q6DID3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scaf8Q6DID3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Scaf8Q6DID3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scaf8Q6DID3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Scaf8Q6DID3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scaf8Q6DID3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scaf8Q6DID3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scaf8Q6DID3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scaf8Q6DID3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scaf8Q6DID3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scaf8Q6DID3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scaf8Q6DID3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scaf8Q6DID3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Scaf8Q6DID3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Scaf8Q6DID3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Scaf8Q6DID3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Scaf8Q6DID3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Scaf8Q6DID3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Scaf8Q6DID3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scaf8Q6DID3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scaf8Q6DID3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scaf8Q6DID3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scaf8Q6DID3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scaf8Q6DID3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scaf8Q6DID3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scaf8Q6DID3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scaf8Q6DID3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scaf8Q6DID3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scaf8Q6DID3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scaf8Q6DID3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scaf8Q6DID3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scaf8Q6DID3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scaf8Q6DID3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scaf8Q6DID3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scaf8Q6DID3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Scaf8Q6DID3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Scaf8Q6DID3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scaf8Q6DID3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scaf8Q6DID3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scaf8Q6DID3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Scaf8Q6DID3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scaf8Q6DID3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Scaf8Q6DID3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Scaf8Q6DID3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Scaf8Q6DID3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scaf8Q6DID3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Scaf8Q6DID3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Scaf8Q6DID3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scaf8Q6DID3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scaf8Q6DID3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scaf8Q6DID3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scaf8Q6DID3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scaf8Q6DID3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scaf8Q6DID3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scaf8Q6DID3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scaf8Q6DID3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scaf8Q6DID3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scaf8Q6DID3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Scaf8Q6DID3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scaf8Q6DID3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Scaf8Q6DID3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Scaf8Q6DID3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scaf8Q6DID3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scaf8Q6DID3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scaf8Q6DID3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scaf8Q6DID3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scaf8Q6DID3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scaf8Q6DID3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scaf8Q6DID3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scaf8Q6DID3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scaf8Q6DID3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scaf8Q6DID3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scaf8Q6DID3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scaf8Q6DID3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scaf8Q6DID3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scaf8Q6DID3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scaf8Q6DID3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms