Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV6

Fndc3c1, Fibronectin type III domain containing protein 3C1, mousemouse

Predictions only

Length 1,356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3c1Q6DFV6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fndc3c1Q6DFV6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fndc3c1Q6DFV6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fndc3c1Q6DFV6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fndc3c1Q6DFV6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fndc3c1Q6DFV6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fndc3c1Q6DFV6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fndc3c1Q6DFV6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fndc3c1Q6DFV6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fndc3c1Q6DFV6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fndc3c1Q6DFV6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fndc3c1Q6DFV6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Fndc3c1Q6DFV6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fndc3c1Q6DFV6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fndc3c1Q6DFV6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fndc3c1Q6DFV6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fndc3c1Q6DFV6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fndc3c1Q6DFV6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fndc3c1Q6DFV6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fndc3c1Q6DFV6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fndc3c1Q6DFV6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Fndc3c1Q6DFV6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fndc3c1Q6DFV6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fndc3c1Q6DFV6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fndc3c1Q6DFV6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fndc3c1Q6DFV6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fndc3c1Q6DFV6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fndc3c1Q6DFV6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fndc3c1Q6DFV6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fndc3c1Q6DFV6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fndc3c1Q6DFV6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fndc3c1Q6DFV6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fndc3c1Q6DFV6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fndc3c1Q6DFV6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fndc3c1Q6DFV6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fndc3c1Q6DFV6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fndc3c1Q6DFV6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fndc3c1Q6DFV6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fndc3c1Q6DFV6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fndc3c1Q6DFV6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fndc3c1Q6DFV6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Fndc3c1Q6DFV6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fndc3c1Q6DFV6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fndc3c1Q6DFV6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fndc3c1Q6DFV6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fndc3c1Q6DFV6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fndc3c1Q6DFV6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Fndc3c1Q6DFV6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fndc3c1Q6DFV6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fndc3c1Q6DFV6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fndc3c1Q6DFV6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fndc3c1Q6DFV6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fndc3c1Q6DFV6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fndc3c1Q6DFV6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fndc3c1Q6DFV6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fndc3c1Q6DFV6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fndc3c1Q6DFV6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Fndc3c1Q6DFV6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fndc3c1Q6DFV6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fndc3c1Q6DFV6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fndc3c1Q6DFV6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fndc3c1Q6DFV6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fndc3c1Q6DFV6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fndc3c1Q6DFV6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fndc3c1Q6DFV6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fndc3c1Q6DFV6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fndc3c1Q6DFV6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fndc3c1Q6DFV6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fndc3c1Q6DFV6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fndc3c1Q6DFV6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fndc3c1Q6DFV6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fndc3c1Q6DFV6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fndc3c1Q6DFV6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fndc3c1Q6DFV6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fndc3c1Q6DFV6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fndc3c1Q6DFV6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fndc3c1Q6DFV6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fndc3c1Q6DFV6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Fndc3c1Q6DFV6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fndc3c1Q6DFV6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fndc3c1Q6DFV6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fndc3c1Q6DFV6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fndc3c1Q6DFV6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fndc3c1Q6DFV6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fndc3c1Q6DFV6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fndc3c1Q6DFV6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fndc3c1Q6DFV6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Fndc3c1Q6DFV6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fndc3c1Q6DFV6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fndc3c1Q6DFV6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Fndc3c1Q6DFV6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Fndc3c1Q6DFV6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fndc3c1Q6DFV6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fndc3c1Q6DFV6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fndc3c1Q6DFV6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Fndc3c1Q6DFV6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fndc3c1Q6DFV6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms