Protein–RNA interactions for Protein: Q6A037

N4bp1, NEDD4-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4bp1Q6A037 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
N4bp1Q6A037 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
N4bp1Q6A037 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
N4bp1Q6A037 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
N4bp1Q6A037 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
N4bp1Q6A037 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
N4bp1Q6A037 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
N4bp1Q6A037 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
N4bp1Q6A037 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
N4bp1Q6A037 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
N4bp1Q6A037 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
N4bp1Q6A037 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
N4bp1Q6A037 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
N4bp1Q6A037 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
N4bp1Q6A037 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
N4bp1Q6A037 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
N4bp1Q6A037 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.3■■□□□ 1
N4bp1Q6A037 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
N4bp1Q6A037 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
N4bp1Q6A037 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
N4bp1Q6A037 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
N4bp1Q6A037 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
N4bp1Q6A037 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.3■■□□□ 1
N4bp1Q6A037 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
N4bp1Q6A037 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
N4bp1Q6A037 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
N4bp1Q6A037 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
N4bp1Q6A037 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
N4bp1Q6A037 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
N4bp1Q6A037 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
N4bp1Q6A037 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
N4bp1Q6A037 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
N4bp1Q6A037 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
N4bp1Q6A037 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
N4bp1Q6A037 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
N4bp1Q6A037 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
N4bp1Q6A037 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
N4bp1Q6A037 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
N4bp1Q6A037 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
N4bp1Q6A037 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
N4bp1Q6A037 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
N4bp1Q6A037 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
N4bp1Q6A037 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
N4bp1Q6A037 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
N4bp1Q6A037 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
N4bp1Q6A037 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
N4bp1Q6A037 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.27■■□□□ 1
N4bp1Q6A037 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
N4bp1Q6A037 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
N4bp1Q6A037 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
N4bp1Q6A037 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
N4bp1Q6A037 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
N4bp1Q6A037 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
N4bp1Q6A037 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
N4bp1Q6A037 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
N4bp1Q6A037 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
N4bp1Q6A037 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
N4bp1Q6A037 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
N4bp1Q6A037 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
N4bp1Q6A037 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
N4bp1Q6A037 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
N4bp1Q6A037 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
N4bp1Q6A037 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
N4bp1Q6A037 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
N4bp1Q6A037 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
N4bp1Q6A037 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
N4bp1Q6A037 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
N4bp1Q6A037 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
N4bp1Q6A037 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
N4bp1Q6A037 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
N4bp1Q6A037 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
N4bp1Q6A037 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
N4bp1Q6A037 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
N4bp1Q6A037 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
N4bp1Q6A037 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
N4bp1Q6A037 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
N4bp1Q6A037 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
N4bp1Q6A037 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
N4bp1Q6A037 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
N4bp1Q6A037 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
N4bp1Q6A037 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
N4bp1Q6A037 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
N4bp1Q6A037 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
N4bp1Q6A037 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
N4bp1Q6A037 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
N4bp1Q6A037 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
N4bp1Q6A037 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
N4bp1Q6A037 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
N4bp1Q6A037 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
N4bp1Q6A037 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
N4bp1Q6A037 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
N4bp1Q6A037 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
N4bp1Q6A037 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
N4bp1Q6A037 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
N4bp1Q6A037 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
N4bp1Q6A037 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
N4bp1Q6A037 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
N4bp1Q6A037 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
N4bp1Q6A037 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
N4bp1Q6A037 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms