Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZU6

Thsd7a, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, mousemouse

Predictions only

Length 1,645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7aQ69ZU6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Thsd7aQ69ZU6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Thsd7aQ69ZU6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Thsd7aQ69ZU6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Thsd7aQ69ZU6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Thsd7aQ69ZU6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Thsd7aQ69ZU6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Thsd7aQ69ZU6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Thsd7aQ69ZU6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Thsd7aQ69ZU6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Thsd7aQ69ZU6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Thsd7aQ69ZU6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Thsd7aQ69ZU6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Thsd7aQ69ZU6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Thsd7aQ69ZU6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Thsd7aQ69ZU6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Thsd7aQ69ZU6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Thsd7aQ69ZU6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Thsd7aQ69ZU6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Thsd7aQ69ZU6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Thsd7aQ69ZU6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Thsd7aQ69ZU6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Thsd7aQ69ZU6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Thsd7aQ69ZU6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Thsd7aQ69ZU6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Thsd7aQ69ZU6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Thsd7aQ69ZU6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Thsd7aQ69ZU6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Thsd7aQ69ZU6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Thsd7aQ69ZU6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Thsd7aQ69ZU6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Thsd7aQ69ZU6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Thsd7aQ69ZU6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Thsd7aQ69ZU6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Thsd7aQ69ZU6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Thsd7aQ69ZU6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Thsd7aQ69ZU6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Thsd7aQ69ZU6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Thsd7aQ69ZU6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Thsd7aQ69ZU6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms