Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atg9aQ68FE2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atg9aQ68FE2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atg9aQ68FE2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atg9aQ68FE2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atg9aQ68FE2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atg9aQ68FE2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atg9aQ68FE2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atg9aQ68FE2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atg9aQ68FE2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atg9aQ68FE2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atg9aQ68FE2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atg9aQ68FE2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atg9aQ68FE2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atg9aQ68FE2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atg9aQ68FE2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atg9aQ68FE2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atg9aQ68FE2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atg9aQ68FE2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atg9aQ68FE2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atg9aQ68FE2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atg9aQ68FE2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atg9aQ68FE2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atg9aQ68FE2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atg9aQ68FE2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Atg9aQ68FE2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atg9aQ68FE2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atg9aQ68FE2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atg9aQ68FE2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atg9aQ68FE2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atg9aQ68FE2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atg9aQ68FE2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atg9aQ68FE2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atg9aQ68FE2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atg9aQ68FE2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atg9aQ68FE2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atg9aQ68FE2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atg9aQ68FE2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atg9aQ68FE2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atg9aQ68FE2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atg9aQ68FE2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atg9aQ68FE2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atg9aQ68FE2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atg9aQ68FE2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atg9aQ68FE2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atg9aQ68FE2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atg9aQ68FE2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atg9aQ68FE2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atg9aQ68FE2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atg9aQ68FE2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atg9aQ68FE2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atg9aQ68FE2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Atg9aQ68FE2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Atg9aQ68FE2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atg9aQ68FE2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atg9aQ68FE2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atg9aQ68FE2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atg9aQ68FE2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atg9aQ68FE2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atg9aQ68FE2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atg9aQ68FE2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atg9aQ68FE2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atg9aQ68FE2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atg9aQ68FE2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atg9aQ68FE2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atg9aQ68FE2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atg9aQ68FE2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atg9aQ68FE2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atg9aQ68FE2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atg9aQ68FE2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atg9aQ68FE2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atg9aQ68FE2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atg9aQ68FE2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atg9aQ68FE2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atg9aQ68FE2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atg9aQ68FE2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atg9aQ68FE2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atg9aQ68FE2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atg9aQ68FE2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atg9aQ68FE2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atg9aQ68FE2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atg9aQ68FE2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atg9aQ68FE2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atg9aQ68FE2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atg9aQ68FE2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atg9aQ68FE2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atg9aQ68FE2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atg9aQ68FE2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atg9aQ68FE2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Atg9aQ68FE2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atg9aQ68FE2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atg9aQ68FE2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atg9aQ68FE2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atg9aQ68FE2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atg9aQ68FE2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Atg9aQ68FE2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atg9aQ68FE2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atg9aQ68FE2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atg9aQ68FE2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atg9aQ68FE2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms