Protein–RNA interactions for Protein: Q64524

Hist2h2be, Histone H2B type 2-E, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2beQ64524 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hist2h2beQ64524 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hist2h2beQ64524 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hist2h2beQ64524 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hist2h2beQ64524 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hist2h2beQ64524 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hist2h2beQ64524 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hist2h2beQ64524 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hist2h2beQ64524 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hist2h2beQ64524 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hist2h2beQ64524 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hist2h2beQ64524 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hist2h2beQ64524 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hist2h2beQ64524 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hist2h2beQ64524 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hist2h2beQ64524 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hist2h2beQ64524 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hist2h2beQ64524 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hist2h2beQ64524 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hist2h2beQ64524 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hist2h2beQ64524 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hist2h2beQ64524 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hist2h2beQ64524 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hist2h2beQ64524 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist2h2beQ64524 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist2h2beQ64524 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist2h2beQ64524 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist2h2beQ64524 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist2h2beQ64524 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist2h2beQ64524 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist2h2beQ64524 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist2h2beQ64524 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist2h2beQ64524 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist2h2beQ64524 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist2h2beQ64524 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist2h2beQ64524 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist2h2beQ64524 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist2h2beQ64524 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist2h2beQ64524 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist2h2beQ64524 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist2h2beQ64524 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist2h2beQ64524 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist2h2beQ64524 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist2h2beQ64524 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist2h2beQ64524 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist2h2beQ64524 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist2h2beQ64524 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist2h2beQ64524 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist2h2beQ64524 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist2h2beQ64524 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist2h2beQ64524 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist2h2beQ64524 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist2h2beQ64524 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hist2h2beQ64524 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hist2h2beQ64524 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hist2h2beQ64524 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hist2h2beQ64524 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hist2h2beQ64524 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hist2h2beQ64524 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hist2h2beQ64524 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hist2h2beQ64524 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hist2h2beQ64524 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hist2h2beQ64524 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hist2h2beQ64524 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hist2h2beQ64524 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hist2h2beQ64524 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hist2h2beQ64524 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hist2h2beQ64524 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hist2h2beQ64524 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist2h2beQ64524 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist2h2beQ64524 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist2h2beQ64524 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist2h2beQ64524 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist2h2beQ64524 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist2h2beQ64524 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist2h2beQ64524 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist2h2beQ64524 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist2h2beQ64524 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist2h2beQ64524 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist2h2beQ64524 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist2h2beQ64524 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist2h2beQ64524 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist2h2beQ64524 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist2h2beQ64524 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist2h2beQ64524 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist2h2beQ64524 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist2h2beQ64524 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist2h2beQ64524 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist2h2beQ64524 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist2h2beQ64524 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist2h2beQ64524 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist2h2beQ64524 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist2h2beQ64524 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist2h2beQ64524 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist2h2beQ64524 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist2h2beQ64524 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist2h2beQ64524 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist2h2beQ64524 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist2h2beQ64524 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist2h2beQ64524 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.8 ms