Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf260Q62513 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf260Q62513 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf260Q62513 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf260Q62513 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf260Q62513 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf260Q62513 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf260Q62513 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf260Q62513 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf260Q62513 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf260Q62513 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf260Q62513 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf260Q62513 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf260Q62513 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf260Q62513 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf260Q62513 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf260Q62513 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf260Q62513 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf260Q62513 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf260Q62513 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf260Q62513 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf260Q62513 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf260Q62513 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf260Q62513 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf260Q62513 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf260Q62513 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf260Q62513 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf260Q62513 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf260Q62513 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf260Q62513 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf260Q62513 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf260Q62513 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf260Q62513 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Znf260Q62513 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Znf260Q62513 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Znf260Q62513 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf260Q62513 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf260Q62513 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf260Q62513 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf260Q62513 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf260Q62513 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf260Q62513 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf260Q62513 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf260Q62513 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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