Protein–RNA interactions for Protein: Q61789

Lama3, Laminin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 3,330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama3Q61789 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lama3Q61789 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lama3Q61789 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lama3Q61789 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lama3Q61789 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lama3Q61789 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Lama3Q61789 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lama3Q61789 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Lama3Q61789 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lama3Q61789 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lama3Q61789 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lama3Q61789 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lama3Q61789 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lama3Q61789 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lama3Q61789 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lama3Q61789 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Lama3Q61789 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lama3Q61789 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lama3Q61789 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lama3Q61789 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lama3Q61789 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lama3Q61789 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lama3Q61789 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lama3Q61789 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lama3Q61789 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lama3Q61789 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lama3Q61789 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lama3Q61789 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lama3Q61789 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lama3Q61789 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lama3Q61789 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lama3Q61789 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lama3Q61789 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lama3Q61789 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Lama3Q61789 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lama3Q61789 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lama3Q61789 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lama3Q61789 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lama3Q61789 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lama3Q61789 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lama3Q61789 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lama3Q61789 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lama3Q61789 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Lama3Q61789 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Lama3Q61789 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lama3Q61789 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lama3Q61789 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lama3Q61789 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lama3Q61789 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lama3Q61789 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lama3Q61789 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lama3Q61789 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lama3Q61789 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lama3Q61789 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lama3Q61789 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lama3Q61789 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lama3Q61789 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lama3Q61789 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lama3Q61789 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lama3Q61789 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lama3Q61789 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lama3Q61789 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lama3Q61789 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lama3Q61789 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lama3Q61789 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lama3Q61789 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lama3Q61789 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lama3Q61789 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Lama3Q61789 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lama3Q61789 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lama3Q61789 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lama3Q61789 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lama3Q61789 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lama3Q61789 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lama3Q61789 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lama3Q61789 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lama3Q61789 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Lama3Q61789 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Lama3Q61789 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Lama3Q61789 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lama3Q61789 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lama3Q61789 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lama3Q61789 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lama3Q61789 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lama3Q61789 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lama3Q61789 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lama3Q61789 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lama3Q61789 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lama3Q61789 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Lama3Q61789 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lama3Q61789 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lama3Q61789 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lama3Q61789 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lama3Q61789 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Lama3Q61789 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lama3Q61789 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Lama3Q61789 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lama3Q61789 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lama3Q61789 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lama3Q61789 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms