Protein–RNA interactions for Protein: Q61765

Krt31, Keratin, type I cuticular Ha1, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt31Q61765 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt31Q61765 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt31Q61765 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt31Q61765 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt31Q61765 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt31Q61765 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt31Q61765 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt31Q61765 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt31Q61765 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt31Q61765 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt31Q61765 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt31Q61765 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt31Q61765 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt31Q61765 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt31Q61765 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt31Q61765 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt31Q61765 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt31Q61765 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt31Q61765 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt31Q61765 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt31Q61765 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Krt31Q61765 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Krt31Q61765 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt31Q61765 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt31Q61765 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt31Q61765 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt31Q61765 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt31Q61765 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt31Q61765 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt31Q61765 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt31Q61765 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt31Q61765 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt31Q61765 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt31Q61765 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt31Q61765 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt31Q61765 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt31Q61765 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt31Q61765 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt31Q61765 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt31Q61765 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt31Q61765 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt31Q61765 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt31Q61765 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt31Q61765 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt31Q61765 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt31Q61765 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt31Q61765 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt31Q61765 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt31Q61765 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt31Q61765 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt31Q61765 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt31Q61765 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt31Q61765 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt31Q61765 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt31Q61765 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt31Q61765 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt31Q61765 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt31Q61765 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt31Q61765 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt31Q61765 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt31Q61765 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt31Q61765 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt31Q61765 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt31Q61765 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt31Q61765 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt31Q61765 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt31Q61765 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt31Q61765 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt31Q61765 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt31Q61765 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt31Q61765 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt31Q61765 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt31Q61765 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt31Q61765 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt31Q61765 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt31Q61765 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt31Q61765 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt31Q61765 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt31Q61765 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt31Q61765 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt31Q61765 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt31Q61765 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt31Q61765 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt31Q61765 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt31Q61765 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt31Q61765 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt31Q61765 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt31Q61765 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt31Q61765 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt31Q61765 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt31Q61765 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt31Q61765 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt31Q61765 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt31Q61765 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt31Q61765 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt31Q61765 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt31Q61765 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt31Q61765 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt31Q61765 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt31Q61765 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms